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一种用于吐鲁番黑羊快速鉴定的SNP位点组合及其应用 

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申请/专利权人:新疆畜牧科学院畜牧研究所;西北农林科技大学

摘要:本发明涉及生物技术领域,具体涉及一种用于吐鲁番黑羊快速鉴定的SNP位点组合及其应用。本发明提供一种用于吐鲁番黑羊快速鉴定的SNP位点组合,包括:第一SNP位点,第二SNP位点,第三SNP位点,第四SNP位点,第五SNP位点,第六SNP位点,第七SNP位点,第八SNP位点,第九SNP位点,第十SNP位点,第十一SNP位点。本发明从大量群体SNP位点中筛选得到适用于吐鲁番黑羊快速鉴定的SNP特征位点组合。应用这些SNP特征位点组合可将吐鲁番黑羊从15个绵羊品种中鉴别出来。

主权项:1.一种用于吐鲁番黑羊快速鉴定的SNP位点组合,其特征在于,所述SNP位点组合包括:第一SNP位点,所述第一SNP位点为:位于吐鲁番黑羊1号染色体56051334位置的碱基C或T;位于吐鲁番黑羊1号染色体148518362位置的碱基A或G;和位于吐鲁番黑羊1号染色体235100056位置的碱基G或A;第二SNP位点,所述第二SNP位点为:位于吐鲁番黑羊2号染色体170361249位置的碱基A或G;第三SNP位点,所述第三SNP位点为:位于吐鲁番黑羊3号染色体94073598位置的碱基C或T;位于吐鲁番黑羊3号染色体94126664位置的碱基A或C;位于吐鲁番黑羊3号染色体96060726位置的碱基A或T;位于吐鲁番黑羊3号染色体96411788位置的碱基C或T;位于吐鲁番黑羊3号染色体96505358位置的碱基T或C;位于吐鲁番黑羊3号染色体98395197位置的碱基G或C;和位于吐鲁番黑羊3号染色体98512230位置的碱基C或T;第四SNP位点,所述第四SNP位点为:位于吐鲁番黑羊8号染色体82065597位置的碱基G或A;第五SNP位点,所述第五SNP位点为:位于吐鲁番黑羊10号染色体31970870位置的碱基C或T;位于吐鲁番黑羊10号染色体32392169位置的碱基A或G;位于吐鲁番黑羊10号染色体32413913位置的碱基C或T;位于吐鲁番黑羊10号染色体32578996位置的碱基C或T;位于吐鲁番黑羊10号染色体32607823位置的碱基G或A;位于吐鲁番黑羊10号染色体32705836位置的碱基G或A;和位于吐鲁番黑羊10号染色体32856410位置的碱基C或T;第六SNP位点,所述第六SNP位点为:位于吐鲁番黑羊12号染色体17926984位置的碱基C或T;位于吐鲁番黑羊12号染色体18054030位置的碱基A或G;位于吐鲁番黑羊12号染色体18094851位置的碱基A或G;位于吐鲁番黑羊12号染色体18231786位置的碱基G或C;位于吐鲁番黑羊12号染色体18391974位置的碱基C或T;位于吐鲁番黑羊12号染色体18434311位置的碱基C或T;位于吐鲁番黑羊12号染色体18450195位置的碱基C或T;位于吐鲁番黑羊12号染色体18614238位置的碱基C或T;位于吐鲁番黑羊12号染色体18629464位置的碱基C或A;位于吐鲁番黑羊12号染色体19093295位置的碱基C或T;位于吐鲁番黑羊12号染色体27549147位置的碱基C或A;位于吐鲁番黑羊12号染色体27652807位置的碱基T或C;位于吐鲁番黑羊12号染色体27834009位置的碱基A或G;位于吐鲁番黑羊12号染色体28649071位置的碱基G或A;位于吐鲁番黑羊12号染色体29019345位置的碱基G或A;位于吐鲁番黑羊12号染色体29337598位置的碱基C或T;位于吐鲁番黑羊12号染色体29649706位置的碱基C或T;位于吐鲁番黑羊12号染色体30033245位置的碱基G或A;位于吐鲁番黑羊12号染色体30078910位置的碱基C或T;位于吐鲁番黑羊12号染色体30088003位置的碱基C或G;位于吐鲁番黑羊12号染色体30344040位置的碱基C或A;位于吐鲁番黑羊12号染色体30724299位置的碱基C或T;位于吐鲁番黑羊12号染色体31130129位置的碱基C或A;和位于吐鲁番黑羊12号染色体31272032位置的碱基C或T;第七SNP位点,所述第七SNP位点为:位于吐鲁番黑羊13号染色体36560505位置的碱基T或C;位于吐鲁番黑羊13号染色体36993560位置的碱基C或T;位于吐鲁番黑羊13号染色体42528464位置的碱基G或A;位于吐鲁番黑羊13号染色体44210047位置的碱基C或T;位于吐鲁番黑羊13号染色体44414519位置的碱基G或A;位于吐鲁番黑羊13号染色体44655182位置的碱基G或C;位于吐鲁番黑羊13号染色体44788195位置的碱基A或T;位于吐鲁番黑羊13号染色体44805577位置的碱基C或T;和位于吐鲁番黑羊13号染色体47655278位置的碱基C或T;第八SNP位点,所述第八SNP位点为:位于吐鲁番黑羊17号染色体6801157位置的碱基C或T;第九SNP位点,所述第九SNP位点为:位于吐鲁番黑羊21号染色体22253455位置的碱基C或T;第十SNP位点,所述第十SNP位点为:位于吐鲁番黑羊24号染色体18892540位置的碱基C或T;位于吐鲁番黑羊24号染色体18925844位置的碱基T或A;位于吐鲁番黑羊24号染色体18976050位置的碱基A或G;位于吐鲁番黑羊24号染色体19159661位置的碱基A或C;位于吐鲁番黑羊24号染色体19412107位置的碱基G或A;位于吐鲁番黑羊24号染色体19900682位置的碱基C或T;位于吐鲁番黑羊24号染色体19923644位置的碱基T或G;位于吐鲁番黑羊24号染色体20229355位置的碱基T或C;位于吐鲁番黑羊24号染色体20449215位置的碱基T或C;和位于吐鲁番黑羊24号染色体30323863位置的碱基A或G;第十一SNP位点,所述第十一SNP位点为:位于吐鲁番黑羊25号染色体35036193位置的碱基A或C;和位于吐鲁番黑羊25号染色体35042644位置的碱基C或T。

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