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申请/专利权人:山东大学
摘要:本发明公开了一种基于k‑truss和图核的图分类方法及其用途。一种基于k‑truss和图核的图分类方法,包括:获取需要分类的图数据,图分类数据的每个样本均带有其类别标签;利用图的k‑truss分解对每个样本建立一个嵌套子图的层次结构;利用truss变体形式的图核函数分别测量每两个图之间的相似性,生成核矩阵,并利用图类别标签信息,训练C‑支持向量机SVM分类器;将待分类的图数据输入训练好的分类器,得到分类结果。本发明的方法方便简洁,计算复杂度低,能够应用到大规模的图数据中。
主权项:1.一种基于k-truss和图核的图分类方法,其特征在于,包括如下步骤:步骤一,从PDB生物大分子结构数据库中下载六种生物酶的三维结构,分别为氧化还原酶类、转移酶类、水解酶类、裂合酶类、异构酶类和连接酶类;将获取的六大类型酶的三维结构建模为图,图的顶点是蛋白质的二级结构,如果两个顶点元素在氨基酸序列或三维空间中是相邻的,它们之间就有一条边;这些图的集合构成了酶的数据集;获取需要分类的图数据,图分类数据的每个样本均带有其类别标签;给定一个样本图G,G的k-truss是G的最大子图,其中每条边至少包含在子图的k-2个三角形中;步骤二,利用图的k-truss分解对每个样本建立一个嵌套子图的层次结构;具体为:1已经知道2-truss就是整个图,所以初始化k=3;2计算所有边的support值,即包含该边的三角形个数;3根据边的support值由小到大的顺序,对边进行排序;4找到一条以u和v为端点的边e,假设u的度数小于等于v的度数,其support值小于k-2,那么对于u的每个邻居w,如果w和v之间也有边存在,即u,v,w构成一个三角形,则将u,w和v,w两边的support值减少1;5从G中删掉边e,更新剩余边的顺序,维护边的support值由小到大的顺序;6重复4和5直到找不到满足support值小于k-2的边,则输出当前G为k-truss;如果此时G不为空,k增加1,重复步骤4-6;如果此时G为空,分解过程结束;步骤三,利用truss变体形式的图核函数分别测量每两个图之间的相似性,生成核矩阵,并利用图类别标签信息,训练C-支持向量机分类器;步骤四,将待分类的图数据输入训练好的分类器,得到分类结果。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 山东大学 一种基于k-truss和图核的图分类方法及其用途
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