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申请/专利权人：中国中医科学院中医临床基础医学研究所
摘要：本发明公开了一种非小细胞肺癌间充质干细胞差异性模块分析的方法及系统，涉及生物技术领域；包括：获取第一样本基因；将第一样本基因中的相似的基因表达划分为不同的基因共表达模块，得到多个共表达模块；计算后获得多个共表达模块对应的目标共表达模块，对其进行比较后获得多个差异性模块；对多个差异性模块进行GO功能分析和KEGG通路富集分析；分析多个差异性模块中的基因对非小细胞肺癌预后的影响；将多个差异性模块中的基因与预设的差异基因相比较，分析多个差异性模块中的差异基因的情况，获取最终分析结果。本发明用于精细化筛选与正常肺组织相比的差异性模块，对差异性模块中不同功能基因在NSCLC治疗和预后方面的价值进行分析。
主权项：1.一种非小细胞肺癌间充质干细胞差异性模块分析的方法，其特征在于，包括以下步骤：S1、筛选并获得非小细胞肺癌-间充质干细胞和相应的正常肺组织-间充质干细胞的表达基因，生成第一样本基因；S2、基于模块药理学平台对所述第一样本基因构建加权共表达网络，并构建矩阵的层次聚类树形图，获取并将相似的基因表达划分为不同的基因共表达模块，得到多个共表达模块；S3、基于模块药理学平台对Zsummary、ME值进行计算，获取并基于计算结果得到所述多个共表达模块对应的目标共表达模块，将所述目标共表达模块与正常间充质干细胞相比较，获得多个差异性模块；S4、对所述多个差异性模块分别进行GO功能分析和KEGG通路富集分析，获得第一分析结果；S5、筛选并获取多个差异性模块中的基因的候选药物，并采用KaplanMeier–Plotter数据库分析所述多个差异性模块中的基因对非小细胞肺癌预后的影响，获得第二分析结果；S6、将所述多个差异性模块中的基因与预设的差异基因相比较，分析所述多个差异性模块中的差异基因的情况，获得第三分析结果；S7、基于所述第一分析结果、第二分析结果以及第三分析结果获取最终分析结果。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中国中医科学院中医临床基础医学研究所 非小细胞肺癌间充质干细胞差异性模块分析的方法及系统
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