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申请/专利权人：南京农业大学
摘要：本发明公开了一种基于基因组代谢模型预测根际有益菌群与病原菌互作的方法，包括：A.将分离后的菌株进行全基因组测序，获得菌株全基因组数据；B.利用gapseq软件，利用菌株全基因组数据构建初始的单菌基因组代谢模型，并预测可利用的资源；C.检测菌株的实际资源利用特性，将菌株缺失的代谢通路利用gapseq软件优化单菌基因组代谢模型，提升模型的代谢预测能力，获得校正的单菌基因组代谢模型；D.基于校正的单菌基因组代谢模型，按照多样性全覆盖的原则，构建有益菌群的基因组代谢模型；E.有益菌群的基因组代谢模型预测有益菌群与病原菌的互作特征。本发明可大幅度缩减时间并开展大规模的共培养互作预测。
主权项：1.一种基于基因组代谢模型预测根际有益菌群与病原菌互作的方法，其特征在于它包括以下步骤：A.将分离后的菌株进行全基因组测序，获得菌株全基因组数据；B.利用gapseq软件，利用菌株全基因组数据构建初始的单菌基因组代谢模型，并预测可利用的资源；C.检测菌株的实际资源利用特性，将菌株缺失的代谢通路利用gapseq软件优化初始的单菌基因组代谢模型，提升模型的代谢预测能力，获得校正的单菌基因组代谢模型；D.基于校正的单菌基因组代谢模型，按照多样性全覆盖的原则，构建有益菌群的基因组代谢模型；E.有益菌群的基因组代谢模型预测有益菌群与病原菌的互作特征。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 南京农业大学 一种基于基因组代谢模型预测根际有益菌群与病原菌互作的方法
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