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哮喘病组学数据的处理方法、处理系统及存储介质 

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申请/专利权人:中国科学院上海营养与健康研究所;国科大杭州高等研究院

摘要:本发明提供了一种哮喘病组学数据的处理方法、处理系统及存储介质。所述处理方法包括以下步骤:获取哮喘病患者和对照样本的转录组数据和DNA甲基化数据;对所述转录组数据和所述DNA甲基化数据进行差异表达分析,以确定所述哮喘病患者和所述对照样本的差异表达基因和差异甲基化位点;经由深度子空间重建算法,改变所述差异表达基因和所述差异甲基化位点的分布情况,以重建获得基因表达矩阵和DNA甲基化表达矩阵;对所述基因表达矩阵和所述DNA甲基化表达矩阵,进行联合深度半监督非负矩阵的分解处理,以构建协同模块;以及经由深度正交典型相关分析和机器学习算法,构建基于所述协同模块的诊断模型,以确定哮喘病相关的生物标志物。

主权项:1.一种哮喘病组学数据的处理方法,其特征在于,包括以下步骤:获取哮喘病患者和对照样本的转录组数据和DNA甲基化数据;对所述转录组数据和所述DNA甲基化数据进行差异表达分析,以确定所述哮喘病患者和所述对照样本的差异表达基因和差异甲基化位点;经由深度子空间重建算法,根据所述哮喘病患者和所述对照样本的组别,改变所述差异表达基因和所述差异甲基化位点的分布情况,以重建获得基因表达矩阵和DNA甲基化表达矩阵;对所述基因表达矩阵和所述DNA甲基化表达矩阵,进行联合深度半监督非负矩阵的分解处理,以构建协同模块;经由深度正交典型相关分析和机器学习算法,构建基于所述协同模块的诊断模型;以及经由所述诊断模型,确定哮喘病相关的生物标志物。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 中国科学院上海营养与健康研究所 国科大杭州高等研究院 哮喘病组学数据的处理方法、处理系统及存储介质

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