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一种动物组织采样管溯源入库管理方法 

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申请/专利权人:石家庄博瑞迪生物技术有限公司

摘要:本发明公开了一种动物组织采样管溯源入库管理方法,具体涉及采样管溯源管理领域,本发明基于深度学习和聚类分析技术,结合固定二维码对动物组织进行溯源管理,通过深度学习和聚类分析,能够对动物组织采样管的状态进行实时更新和查阅,并能够自动识别和分类组织样本的异常状态,提高对于动物组织采样管溯源管理能力。

主权项:1.一种动物组织采样管溯源入库管理方法,其特征在于,包括以下步骤:S1.系统通过留存标签采集用户录入的采样管入样时的初始留存信息,所述初始留存信息包括初始样本数值和初始样本图片;S2.系统通过展示标签对当前的留存信息进行信息展示;S3.当用户需记录当前样本的状态信息时,通过留存标签进入系统进行信息录入,当前样本的状态信息对初始留存信息进行更新,根据获取的留存信息分别建立历史组织数据集和历史组织图像集,所述历史组织数据集包括样本的实验数值及参数,所述历史组织图像集包括采集时段的组织微观图像,所述样本的状态信息包括样本数值和样本图片,所述历史组织数据集通过样本数值建立,所述历史组织图像集通过样本图片建立;S4.通过CNN深度学习算法分析历史图像集,识别组织结构或细胞形态的异常状态;并通过K-means聚类分析分析历史组织数据集,识别组织或细胞类型是否存在异常;S5.根据数据分析结果,系统自动生成关于样本状态的提示结果;所述步骤S4中,通过K-means聚类分析分析历史组织数据集,识别组织或细胞类型是否存在异常具体包括以下子步骤:S4021.采集细胞密度D,平均细胞大小,形态变异性作为样本特征;S4022.使用K-means聚类算法,将数据集中的样本根据样本特征进行聚类,定义目标函数并迭代更新直至收敛;S4023.根据聚类结果对组织结构异常进行识别;其中,对于细胞密度的计算方法:在区域内计数细胞的数量,然后除以该区域的面积;即;对于平均细胞大小的计算方法:测量一定数量的细胞的尺寸,然后计算平均值;即;对于形态变异性的计算方法:测量细胞形状的标准差或形状系数;即;所述步骤S4中,通过CNN深度学习算法分析历史图像集具体包括以下子步骤:S4011.采集包含正常和异常的组织或细胞图像,并对图像进行预处理,对图像中的关键组织特征进行标记,所述关键组织特征包括:细胞密度D,形态不规则性I,颜色分布异质性H;S4012.建立CNN模型,包含组织特征D,I,H的卷积层:,其中,所述表示激活函数,所述和表示循环变量,用于遍历卷积核的所有元素,所述表示卷积核的高度,所述V表示卷积核的宽度,所述表示第层的卷积核中的权重,所述表示输入特征图的元素,即结合了D,I,H的输入数据,所述表示输入特征图中相对于当前位置的偏移位置,所述表示第层的偏置项,所述表示前特征图输出的位置坐标;S4013.使用交叉熵损失函数进行训练,其中,所述表示真实标签,所述表示模型对于每个类别的预测概率,所述表示对模型预测的概率取自然对数,所述表示计算真实标签与模型预测概率之间的交叉熵;S4014.将训练好的CNN模型应用于测试集和新样本,进行组织结构异常的识别;所述步骤S5根据数据分析结果,系统自动生成关于样本状态的提示结果中,其分析步骤具体为:当一个样本在CNN中被识别为异常,并且在K-means聚类分析中属于一个具有异常特征的簇,那么该样本代表异常状态,具体的判断规则如下:在CNN模型输出的分类概率中,设置一个阈值来判断样本是否异常,当模型预测的异常概率超过这个阈值,样本被视为异常;在每个簇中,计算样本特征的平均值和标准差,异常高或低的平均值,或异常大的标准差指示异常;比较不同簇之间的特征差异,显著偏离其他簇的特征分布表明该簇代表一种异常状态;将聚类结果与已知的异常类型进行比较,当某个簇的特征与已知异常类型匹配,则该簇代表相应的异常状态。

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