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杉木优树群体的多态性SSR引物及其应用 

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申请/专利权人:南京林业大学

摘要:本发明公开了杉木优树群体的多态性SSR引物及其应用,属于遗传改良技术领域。本发明运用两种方法开发20对引物,分析杉木优树6个群体共112株个体的遗传多样性和遗传结构。遗传多样性分析结果表明,群体遗传多样性适中,其中江西赣州遗传多样性最高、四川德昌群体最低。分子方差分析发现仅9.42%的遗传变异来自群体间,而90.58%的遗传变异来自于群体内。STRUCTURE和UPGMA划分结果相一致,四川德昌群体SCDC被单独划分为一个类群,这与其地理隔离有关。

主权项:1.杉木优树群体的多态性SSR引物,其特征在于,所述的多态性SSR引物共有20对,其核苷酸序列如下:P189-F:TTGTTTGAGAGGCTGGGGTG,P189-R:GGAGCTGCTGTGCGATTCTA;P213-F:GCGACTTTGCACCTTCCATC,P213-R:TCAGCTCCTCCAGAAACCCT;P215-F:CCTAGGGTCAGAGGCAGAGG,P215-R:TGTAAGTGCCGCGATCAGAA;P243-F:TTCTGGTTCCCGTTACGGTG,P243-R:CATCTCCTCCAGCTGCCTTC;P265-F:ACATGCTTGTTGACCTCCTCA,P265-R:CTCCTCTGGGCGAACTTCTC;P299-F:GTAGCCATGGAAAGCCCTGT,P299-R:GAGACGGCAAAAGACCAGGA;P301-F:CAGCAGCAGCAACAACAACA,P301-R:TTGAGACAGCCGGATTGGAC;P305-F:ATGTGTCGGAGTTGGGGTTC,P305-R:AAGTGAAAGAGAAGGGCGGG;P351-F:AAAAATCCCTGGCGGTGGAT,P351-R:AACAAACCCCCGTCACTTGT;P375-F:CCCTGGTCATCATTCAGCCC,P375-R:AGCCTGCCCAAAATCAAAACC;P379-F:CAGCCGCAAAGAAAGAAGCT,P379-R:GCTTCGTAGCCATGTTTTGGATT;P383-F:AGATTTCACTGGAGGTGGCG,P383-R:CAAGCACGCATAGCCAAGTG;P7-F:AGCTCCACTCCGCAAATAGT,P7-R:CTTGAACTTCAGCCATGGAA;P13-F:GGCAATGCTTACTGTGGAGA,P13-R:TACAGTCACTGCCTGCTCCT;P55-F:TACCATCCAAACCCACATCC,P55-R:AACAGTTATGGCCCGTCAAG;P75-F:ACCCAGATTGCCTCAT,P75-R:CAGTTACAGTAGTGCTTCC;P101-F:TGTTCTTCATGCCAGCATCT,P101-R:CACCACCTCCTCCTCCATAC;P105-F:AGAATGGGCAGTCGCTAATC,P105-R:GGGAAATCAGATACGGAGGA;P127-F:TCCTTTCCTTGTAGCCCATT,P127-R:CTAAAGCCAGGAGGAAGCTC;P153-F:AGATAGTTCTCCCAGGCTATCCAAGAT,P153-R:CCACCTACATACAACATAAGCGACCAA。

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