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多肽毒性确定方法、装置、设备及存储介质 

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申请/专利权人:北京悦康科创医药科技股份有限公司

摘要:本发明涉及医药技术领域,公开了一种多肽毒性确定方法、装置、设备及存储介质,该方法包括:获取待确定毒性的多肽和对应的受体的序列信息、结构信息和组成特征信息;将多肽和受体的组成特征信息,输入至第一提取模型,得到第一特征张量;将多肽和受体的结构信息,输入至第二提取模型,得到第二特征张量;将多肽和受体的序列信息,输入至第三提取模型,得到第三特征张量;通过交叉注意力模型得到第一特征张量、第二特征张量和第三特征张量之间的交互特征张量;将交互特征张量输入分类模型中,得到多肽毒性预测值。本发明能够提升多肽毒性预测的准确性。

主权项:1.一种多肽毒性确定方法,其特征在于,所述方法包括:获取待确定毒性的多肽和对应的受体的序列信息、结构信息和组成特征信息;将所述多肽和所述受体的组成特征信息,输入至第一提取模型,得到第一特征张量;将所述多肽和所述受体的结构信息,输入至第二提取模型,得到第二特征张量;将所述多肽和所述受体的序列信息,输入至第三提取模型,得到第三特征张量;其中,所述第一提取模型为1维的VisionTransformer模型,所述第二提取模型为2维的VisionTransformer模型,所述第三提取模型为Star-Transformer模型;通过交叉注意力模型得到所述第一特征张量、所述第二特征张量和所述第三特征张量之间的交互特征张量;将所述交互特征张量输入分类模型中,得到多肽毒性预测值,所述分类模型为多个卷积神经网络;其中,所述将所述多肽和所述受体的结构信息,输入至第二提取模型,得到第二特征张量,包括:获取所述多肽的结构图和所述受体的结构图;对所述多肽的结构图和所述受体的结构图进行裁剪和或调整像素大小,得到调整后的结构图对;将所述调整后的结构图对进行拼接;将拼接得到的结构图输入至所述第二提取模型,得到所述第二特征张量;所述将所述多肽和所述受体的序列信息,输入至第三提取模型,得到第三特征张量,包括:将所述多肽和所述受体的序列信息中的修饰分别替换为修饰基团词元;分别将所述多肽和所述受体的序列信息中除所述修饰以外的部分进行词元切分,得到所述多肽和所述受体的序列词元信息;将所述多肽和所述受体的序列词元信息进行拼接,得到拼接后的序列词元信息;将所述拼接后的序列词元信息输入至所述第三提取模型,得到所述第三特征张量;所述多肽毒性确定方法还包括:构建基于交叉注意力的多肽毒性预测模型,所述基于交叉注意力的多肽毒性预测模型包括所述第一提取模型、所述第二提取模型、所述第三提取模型、所述交叉注意力模型和所述分类模型;收集将多肽样本和对应的受体样本的序列信息、组成特征信息、结构信息和多肽毒性标签;将所述多肽样本和对应的受体样本的序列信息、组成特征信息、结构信息输入至所述基于交叉注意力的多肽毒性预测模型,输出对应的样本多肽毒性预测值;基于所述样本多肽毒性预测值和所述多肽毒性标签对所述基于交叉注意力的多肽毒性预测模型进行参数调整。

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