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申请/专利权人：西安电子科技大学
摘要：本发明提供一种基于强化隐扩散模型的共价药物从头设计方法及相关装置，包括构建共价药物从头设计网络并进行训练得到共价药物从头设计网络模型；选定一个蛋白质作为靶点，从标准正态分布中采样一个隐向量，将蛋白质序列和隐向量输入共价药物从头设计网络模型得到与选定蛋白质可以共价结合的药物分子；采用隐扩散模型的架构来实现配体分子的设计，生成能与给定蛋白质靶点结合的具有所需性质的共价药物配体分子，在保证生成分子在与给定蛋白质靶点具有优良结合能力的同时保证其具有优良的包括可合成性在内的药物性质，优化生成的分子的急性毒性，提高安全性，拓宽设计出的药物分子的剂量设计尺度，提升其被进一步开发成为上市药物的能力。
主权项：1.一种基于强化隐扩散模型的共价药物从头设计方法，其特征在于，具体步骤如下：S1构建共价药物从头设计网络并进行训练得到共价药物从头设计网络模型；S2选定一个蛋白质作为靶点，从标准正态分布中采样一个隐向量，将蛋白质序列和隐向量输入共价药物从头设计网络模型得到与选定蛋白质可以共价结合的药物分子；所述共价药物从头设计网络包括变分自编码器、蛋白质序列编码器和隐扩散模型，变分自编码器用于将分子SMILES编码为隐向量和把隐向量解码为药物分子；蛋白质序列编码器用于将蛋白质靶点信息进行编码，得到蛋白质靶点序列编码；隐扩散模型包括向前扩散模块、噪声预测网络εθ和分类器模型，向前扩散模块用于逐步为隐向量加噪，噪声预测网络εθ用于将隐向量和蛋白质靶点信息融合，并在分类器模型的引导下进行反向去噪，预测得到与蛋白质靶点共价结合的药物分子的隐向量；利用毒性预测模型对得到的蛋白质靶点共价结合的药物分子进行急性毒性的打分，根据打分结果更新隐扩散模型，得到急性毒性低的与蛋白质靶点共价结合的药物分子。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 西安电子科技大学 基于强化隐扩散模型的共价药物从头设计方法及相关装置
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