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申请/专利权人：复旦大学

摘要：本发明涉及生物技术领域，具体涉及肺腺癌亚型分子分型模型构建方法、分型设备、装置以及试剂盒。通过测定肺腺癌患者肿瘤组织COL11A1和THBS2等基因表达值，基于PAM算法构建肺腺癌患者进行分子分型模型，根据不同分型的预后特点进行，临床个性化诊疗。本发明的优点：能够将肺腺癌患者分成稳定的两类亚型，S1预后好和S2预后差，S1亚型的分子趋近原位癌微浸润癌，而S2亚型与原位癌微浸润癌分子差异明显。S2亚型拥有更活跃的肿瘤纤维化细胞CAF，可以使用CAF抑制剂进行术后辅助治疗，为临床医生匹配药物和精准选择治疗方案提供了依据。

主权项：1.一种肺腺癌分子分型模型的构建方法，使控制程序利用PAM（PartitioningAroundMedoids）算法对肺腺癌患者进行分子分型，控制软件执行如下操作：（1）以COL11A1的表达值作为X轴、THBS2的表达值作为Y轴，任选的，以COL1A1、COL3A1、COL5A2、COL6A6、CAV1、CAV2、COMP、ITGA11、LAMA3、SPP1、TNXB、VEGFD和VWF基因中的任意0种或多种基因的表达值作为2-15维空间的坐标轴的0个轴或多个轴，将n个样本依据上述2-15个基因的表达值在空间直角坐标系中找到其对应的位置；（2）从上述n个样本中随机选取K个样本，以其在2-15维空间直角坐标系中的位置作为中心点1和中心点2...中心点K，并基于各中心点的标记，将上述样本分为K种类型，命名为A1、A2...AK；（3）测定其余n-K个样本到中心点1、中心点2...以及中心点K的欧氏距离，比较上述欧式距离的大小，样本离哪个中心点的欧氏距离更小就属于哪一类分型；（4）根据分型结果，测定n-K个样本距离所在分型中心点的欧式距离，若样本被分为A1型，则计算该样本距离中心点1的欧式距离；若样本被分为A2型，则计算该样本距离中心点2的欧式距离；若样本被分为AK型，则计算该样本距离中心点K的欧式距离,计算上述欧式距离之和，并把该数值称为损失值；（5）选择K种样本以外的样本，并将该样本在2-15维空间直角坐标系中的位置作为新的中心点替换中心点1、中心点2...或中心点K中的任意一个；（6）重复步骤（1）-（5），并计算出新的损失值，如果新的损失值与原有损失值相比增大，那么原有中心点不被替换，如果损失变小，用新中心点替换原有中心点，（7）循环替换所有样本，直至收敛，即各中心点不再改变，此时中心点的数量就是最终确定的分型数量；则分型模型构建完毕。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 复旦大学 一种肺腺癌分子分型模型的构建方法、设备、装置以及试剂盒