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申请/专利权人:广州医科大学
摘要:本发明提供了一种在单核苷酸精度水平上检测低丰度ac4CRNA的测序技术。本发明使用优化的ac4C‑seq方法,可以以50ng的RNA起始量进行NaCNBH3化学反应。进一步地,该方法可以联合NH2OH去乙酰化处理作为阴性对照,可以大大降低假阳性的效果。更进一步地,发明人利用ac4C抗体富集ac4C修饰的RNA,再进行NaCNBH3化学反应,建库和测序。通过两种方法结合,本发明实现了以低起始量、高分辨率、高效率和高通量的优点检测到更多低丰度ac4C修饰的RNA。
主权项:1.一种在单核苷酸精度水平上检测低丰度ac4CRNA的测序技术,其特征在于:包括如下步骤:S1、提取RNA,利用ac4C抗体富集N4-乙酰胞苷修饰的RNA,得到RNA样本;S2、将步骤S1所得RNA样本进行NaCNBH3处理及建库,得到cDNA库;S3、将步骤S2所得cDNA库进行测序;步骤S3的具体步骤为:运用测序方法对步骤S2所得cDNA库进行测序,基于参考基因组数据,得出CT突变的位点,待测组与阴性对照组进行对比,最终鉴定出待测样本中发生ac4C修饰的位点,以及计算待测样本中RNA的N4-乙酰胞苷修饰程度。
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权利要求:
百度查询: 广州医科大学 一种在单核苷酸精度水平上检测低丰度ac4C RNA的测序技术
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