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基于靶向测序分型的凡纳滨对虾亲缘关系的鉴定方法和应用 

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申请/专利权人:中国科学院海洋研究所

摘要:本发明属于水产动物分子育种领域,具体涉及一种基于靶向测序分型的凡纳滨对虾亲缘关系的鉴定方法和应用。通过优化设计在凡纳滨对虾基因组上筛选出200个分布均匀、多态性高的DNA片段,利用多重PCR同时扩增200个目的片段,并通过二代测序和生物信息学分析获得靶向区域的1100个以上的SNP位点,利用该这些SNP位点通过分子亲缘关系分析,能够实现不同来源种质的精准鉴定,利用Sequioa等家系鉴定软件,可以实现不同家系的精准区分。本发明提供的技术方案具有SNP分型成本低、种质和家系鉴定准确率高的特点,可以用于商业化种质的鉴定和遗传育种中的家系鉴定,在对虾种业中应用前景广阔。

主权项:1.一种基于靶向测序分型的凡纳滨对虾亲缘关系的鉴定方法,其特征在于:通过用于靶向扩增凡纳滨对虾基因组中多态性高、基因组分布均匀区段的引物序列进行多重PCR扩增,获得待检测不同个体的目标序列,之后通过高通量测序和生物信息学分析实现目标片段中的SNP分型,根据不同个体的基因分型结果,通过分子亲缘关系分析软件确定个体的亲缘关系;用于靶向扩增目标区段的特异性引物如SEQIDNO:1-SEQIDNO:400所示。

全文数据:

权利要求:

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