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一种基于贝叶斯优化的多肽筛选方法和装置 

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申请/专利权人:之江实验室

摘要:本发明公开了一种基于贝叶斯优化的多肽筛选方法和装置,该方法在原始天然肽的基础上,充分结合分子动力学和分子对接等多种结合模拟手段,基于贝叶斯优化筛选出高亲和力的多肽序列;对天然多肽和蛋白进行分子对接;使用贝叶斯优化进行多肽突变生成新的多肽序列,并进行分子对接;使用构建的多肽蛋白的目标函数,基于贝叶斯优化筛选出推荐的多肽序列,不断迭代循环,最终筛选出高亲和力的突变多肽。本发明能够解决多肽药物序列生成高亲和力肽序列较为困难的行业痛点,能够很好的开展多肽蛋白间的优化筛选,基于贝叶斯优化不断迭代出极高亲和力的多肽序列,为大分子药物设计提供了一体化的生成与筛选流程。

主权项:1.一种基于贝叶斯优化的多肽筛选方法,其特征在于,包括以下步骤:1使用Autodock-vina软件对天然多肽和蛋白进行分子对接;2基于所述步骤1获得的多肽和蛋白的对接结果制定突变策略,根据突变策略使用贝叶斯优化进行多肽突变,以生成新的多肽序列,并使用Autodock-vina软件进行分子对接;3根据所述步骤2得到的多肽和蛋白的对接结果,构建多肽蛋白的目标函数;4使用所述步骤3构建的目标函数,基于贝叶斯优化筛选出推荐的多肽序列,得到推荐的氨基酸突变位点;5依据推荐的氨基酸突变位点,重复所述步骤2-所述步骤4,直至达到预设的迭代循环轮次,得到最终筛选出的突变多肽。

全文数据:

权利要求:

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