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申请/专利权人:四川轻化工大学
摘要:本发明公开了一种系统生物学分析代谢物合成关联微生物与子群落方法,涉及生物信息技术领域,通过获取待检测样本的重叠DNA序列和检测代谢物质;对重叠DNA序列进行分箱处理;对宏基因组组装基因组进行筛选;对高质量宏基因组组装基因组进行注释和分类;基于高质量宏基因组组装基因组的分类学信息和注释信息构建代谢网络模型;利用代谢网络模型预测高质量宏基因组组装基因组的代谢物质,得到预测代谢物质;根据检测代谢物质和预测代谢物质,确定目标代谢物质;根据预测代谢物质,确定和目标代谢物质合成相关的微生物和子群落,具备广泛适用性和简便易行的特点,整个流程简单可靠,准确度高,易于理解和操作,方便实施。
主权项:1.一种系统生物学分析代谢物合成关联微生物与子群落方法,其特征在于,所述方法包括:获取待检测样本的重叠DNA序列和检测代谢物质;对所述重叠DNA序列进行分箱处理,得到宏基因组组装基因组;对所述宏基因组组装基因组进行筛选,得到高质量宏基因组组装基因组;对所述高质量宏基因组组装基因组进行注释和分类,得到分类学信息和注释信息;基于所述高质量宏基因组组装基因组的分类学信息和注释信息构建代谢网络模型;利用所述代谢网络模型预测所述高质量宏基因组组装基因组的代谢物质,得到预测代谢物质;根据所述检测代谢物质和预测代谢物质,确定目标代谢物质;根据所述预测代谢物质,确定和所述目标代谢物质合成相关的微生物和子群落。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 四川轻化工大学 系统生物学分析代谢物合成关联微生物与子群落方法
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