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申请/专利权人:安徽医科大学
摘要:本发明提供去偏差的药物‑药物相互作用预测方法及系统,方法包括:利用TrimNet网络学习药物分子,使用Set2set将学习到的图数据转为药物特征;将药物特征作为DDI图的节点特征,分别通过扰乱该图上的边与节点特征得到两个增强图;利用权重共享R‑GCN作为编码器进行对比学习,得到图嵌入特征;对图嵌入特征,构造流行性去偏损失函数;将得到的各个药物特征组合为药物对特征,利用MLP学习药物对特征,得到药物相互作用关系种类的评分;对药物对特征构造同质性去偏的互信息目标函数;优化目标函数,迭代得到最优模型,利用评估函数评价模型性能。本发明解决了药物互相作用预测模型存在全局交互语义的局限性,以及流行性偏差、同质性偏差导致药物‑药物相互作用预测准确率较低的技术问题。
主权项:1.去偏差的药物-药物相互作用预测方法,其特征在于,所述方法包括:S1、利用TrimNet网络学习药物分子,以得到药物分子图,使用Set2set模块将所述药物分子图转为药物特征;S2、将所述药物特征作为DDI图的节点特征,预置一个原始DDI图G,扰乱所述原始DDI图G上的边、节点特征,以将所述原始DDI图G变换为所述边增强DDI图Gedge、所述边缘破坏特征特征交换增强DDI图Gfedge;S3、利用权重共享R-GCN编码器进行对比学习,得到所述原始DDI图G、所述边增强DDI图Gedge以及所述边缘破坏特征交换增强DDI图Gfedge的图嵌入特征;S4、针对来自不同节点分布的所述图嵌入特征,获取区分得分,构造基于互信息的流行性去偏损失函数;利用互信息估计器,根据所述区分得分处理得到获取对比学习目标函数,据以获取所述图嵌入特征的区分得分;S5、将各所述图嵌入特征组合为药物对特征,利用多层感知机MLP学习所述药物对特征,得到药物相互作用关系种类评分;S6、针对所述药物对特征,构造同质性去偏的互信息目标函数,以对所述药物对特征进行去同质性偏差操作,以得到优化特征;S7、获取并优化所述互信息目标函数,通过迭代训练得到适用模型,利用所述适用模型,根据所述优化特征进行药物相互作用预测,利用预置评估函数评价所述适用模型。
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权利要求:
百度查询: 安徽医科大学 去偏差的药物-药物相互作用预测方法及系统
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