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一种樟树的SSR分子标记的应用 

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申请/专利权人:江西省科学院生物资源研究所

摘要:本发明公开了一种樟树的SSR分子标记的应用,属于植物基因工程技术领域。本发明利用筛选出的多态性较高的SSR引物对樟树亲本和所有半同胞群体进行遗传多样性研究,揭示樟树现有群体的遗传多样性,分析遗传多样性的发展趋势,为保护樟树种质资源、选育优树、合理利用樟树种质资源提供参考。本发明的红杆樟父本分析提供了子代父本组成、花粉传播方向和距离、自交率等信息,可广泛应用于种群进化学研究。此外,父本分析在实践中可以给林木群体内优良基因的交配提供依据,对人工林的营建和遗传改良具有重要意义。

主权项:1.樟树的SSR分子标记的引物组在半同胞家系或亲本群体遗传多样性分析或红杆樟父本分析中的应用,其特征在于,所述的SSR分子标记的引物组序列包括如下所示:SSR1:F:5′-CGCCCCGAGCGATCTTGATT-3′,R:5′-CCGCCACCGACTTCTGATCC-3′;SSR2:F:5′-ACCCCATCCTCCCCAAGACC-3′,R:5′-TCGCGCCCCTTGACAAACTT-3′;SSR3:F:5′-AGCGGAGATCCAACGGTCCT-3′,R:5′-AGCCGCAAATGCAGAGTCCT-3′;SSR4:F:5′-TACTGGCGCGCGAAGGAAAT-3′,R:5′-ACTCGAAAGCCTCCACGCTG-3′;SSR5:F:5′-TCCCAGCTCTTCAATCGCTCT-3′,R:5′-TCCACTTGCCATATCATCCGGT-3′;SSR6:F:5′-GGGCCAACATGCTACCTCGT-3′,R:5′-TGGGCTTGTTGCTTGGACCT-3′;SSR8:F:5′-CGCATGACCAGATGCAACCC-3′,R:5′-GATGGCTGCGCCCATTAAGC-3′;SSR11:F:5′-TGAGGGTTCTTACTGCAATAGCG-3′,R:5′-ACAGAAGCCGGATGACGCAG-3′;SSR12:F:5′-GCTCTCGTGACAATGGCGGA-3′,R:5′-TGGTGGGATGGAAATGGCCG-3′;SSR13:F:5′-CGCTGCTGCACTTGAAGCTC-3′,R:5′-CACCAGCAGTCTGTCAGCCC-3′;SSR14:F:5′-GGGTGGGTAGGACGTTGAGC-3′,R:5′-CTCATGTGTCCATGCATGAGTTGT-3′;SSR15:F:5′-AGTTAATAGCACGGAAAGTCAACATGA-3′,R:5′-TAAATACTGAGGCTACTGATGGCACC-3′;SSR17:F:5′-CAGCACCAGCAGTGGCAGTA-3′,R:5′-CGGGCTATGCTGCTTACGGT-3′;SSR19:F:5′-TCAATTGAGCGGGCCCTGTG-3′,R:5′-ATGGACGGCTGATGCAGTGG-3′;SSR21:F:5′-GCACACTGATGCGCAGATGG-3′,R:5′-TGTGCGGTCCACTTTGTGAA-3′;SSR23:F:5′-GGTTGCTTGGCACAAAGCCG-3′,R:5′-TCGCATCTCGAGGGACATCCT-3′;SSR28:F:5′-TTTCTTCCTCACCACCATTTGAGGG-3′,R:5′-ACCTTTCATCACCTGCGCTT-3′;SSR29:F:5′-TCTCGTGGCTCGACCTGCTA-3′,R:5′-GTCTCCGCAAAGCTCCCTGG-3′;SSR31:F:5′-CCCATCAGGACGCCTTCGAC-3′,R:5′-TCCGCTTGAATCCCTGCACA-3′;SSR33:F:5′-AGTAGGCAGGAGAGGACATGGA-3′,R:5′-CCATCACCACCAACGTCACCA-3′;SSR35:F:5′-GAATCTCGGCCGTCCGCATC-3′,R:5′-CCGAGGGCGAGGAGGTAGAA-3′;SSR36:F:5′-TCTGCAACACAAAGCGAATTCCA-3′,R:5′-ACCCGGGTTAACCAAACACATGA-3′。

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