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申请/专利权人：富鲁达公司
摘要：本申请涉及核酸编码反应。描述了可用于向一个、或典型地多个靶核苷酸序列掺入一个或多个衔接子和或核苷酸标签和或条形码核苷酸序列的方法。在具体实施方案中，产生了具有衔接子的核酸片段，例如适于用在高通量DNA测序中的核酸片段。在其他实施方案中，将有关反应混合物的信息编码到反应产物中。还描述了在制备用于应用诸如双向核酸测序中可用于扩增一个或多个靶核酸的方法和试剂盒。在具体实施方案中，本申请的方法包括另外进行双向DNA测序。还描述了通过引物延伸编码和检测和或定量等位基因的方法。
主权项：1.一种分析单颗粒中的核酸或与单颗粒缔合的核酸的方法，所述方法包括：a在单独反应体积中捕获颗粒，使得多个反应体积的每个包含单颗粒，其中所述单独反应体积是乳液中的液滴；b从每个单独反应体积中的单颗粒中的核酸产生条形码化的反应产物或从与每个单独反应体积中的单颗粒缔合的核酸产生条形码化的反应产物，其中产生所述反应产物包括对于每个单独反应体积，使用多个不同的单链条形码化的衔接子分子将条形码化的衔接子核苷酸序列掺入到所述反应产物中，其中每个衔接子分子以5’到3’的方向包含：i包含引物结合位点的核苷酸序列，ii条形码核苷酸序列，和iii简并尾序列，其中所述多个不同的单链条形码化的衔接子分子的所述简并尾序列包括所述尾序列的所有可能的不同核苷酸序列，每个衔接子分子具有与所述尾序列不同的可能的核苷酸序列中的一个，并且其中对于同一单独反应体积的所述多个不同的单链条形码化的衔接子分子包含相同的条形码；c汇集所述条形码化的反应产物；d使用结合所述引物结合位点的引物扩增所述条形码化的反应产物来产生用于双向DNA测序的模板；和e对所述条形码化的反应产物测序。
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