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申请/专利权人:海南芯玉科技有限公司
摘要:本发明提供了一种用于检测SNP位点组合的产品在检测玉米抗锈基因RppK或玉米抗锈性状中的应用,涉及植物分子育种技术领域。本发明提供了用于检测SNP位点组合的产品在检测玉米抗锈基因RppK或者玉米抗锈性状中的应用,其中SNP位点组合包括A组或者A组的连锁位点。经发明人研究发现,本发明筛选得到的SNP位点组合能够用于鉴定玉米抗锈基因RppK,进而判断玉米的表型,相较于现有技术更加高效、直接,同时避免单标记检测失败带来的误差。在筛选相关的SNP位点后,通过连锁不平衡分析,将抗锈基因RppK的鉴定锚定在了基因芯片上,为以后多基因、多性状的鉴定,以及实现优良基因聚合等提供了很大可能。
主权项:1.用于检测SNP位点组合的产品在检测玉米抗锈基因RppK中的应用,其特征在于,所述SNP位点组合包括A组和或A组的连锁位点;所述A组包括:SNP1位于Chr10第1137733位,其脱氧核苷酸为A;SNP2位于Chr10第1413548位,其脱氧核苷酸为A;SNP3位于Chr10第1538365位,其脱氧核苷酸为T;SNP4位于Chr10第1538409位,其脱氧核苷酸为A;SNP5位于Chr10第1538477位,其脱氧核苷酸为C;SNP6位于Chr10第1559917位,其脱氧核苷酸为A;SNP7位于Chr10第1724438位,其脱氧核苷酸为C;SNP8位于Chr10第1724570位,其脱氧核苷酸为C;SNP9位于Chr10第1772409位,其脱氧核苷酸为T;SNP10位于Chr10第1775714位,其脱氧核苷酸为T;SNP11位于Chr10第1777138位,其脱氧核苷酸为T;SNP12位于Chr10第1778718位,其脱氧核苷酸为G;SNP13位于Chr10第1779695位,其脱氧核苷酸为C;SNP14位于Chr10第1781995位,其脱氧核苷酸为T;SNP15位于Chr10第1804216位,其脱氧核苷酸为T;SNP16位于Chr10第1879733位,其脱氧核苷酸为G;SNP17位于Chr10第1879795位,其脱氧核苷酸为A;SNP18位于Chr10第1880302位,其脱氧核苷酸为A;SNP19位于Chr10第1880362位,其脱氧核苷酸为C;SNP20位于Chr10第1880455位,其脱氧核苷酸为C;SNP21位于Chr10第1880520位,其脱氧核苷酸为G;SNP22位于Chr10第1880593位,其脱氧核苷酸为A;SNP23位于Chr10第1880764位,其脱氧核苷酸为C;SNP24位于Chr10第1902477位,其脱氧核苷酸为G;SNP25位于Chr10第1902478位,其脱氧核苷酸为A;SNP26位于Chr10第2029790位,其脱氧核苷酸为G;SNP27位于Chr10第2048426位,其脱氧核苷酸为G;SNP28位于Chr10第2052981位,其脱氧核苷酸为G;SNP29位于Chr10第2053049位,其脱氧核苷酸为C;SNP30位于Chr10第2223350位,其脱氧核苷酸为C;SNP31位于Chr10第2223834位,其脱氧核苷酸为C;SNP32位于Chr10第2223937位,其脱氧核苷酸为A;SNP33位于Chr10第2224052位,其脱氧核苷酸为T;SNP34位于Chr10第2224121位,其脱氧核苷酸为A;SNP35位于Chr10第2224744位,其脱氧核苷酸为A;SNP36位于Chr10第2225050位,其脱氧核苷酸为A;SNP37位于Chr10第2225594位,其脱氧核苷酸为A;SNP38位于Chr10第2226292位,其脱氧核苷酸为A;SNP39位于Chr10第2226514位,其脱氧核苷酸为T;SNP40位于Chr10第2227055位,其脱氧核苷酸为G;SNP41位于Chr10第2227081位,其脱氧核苷酸为A;SNP42位于Chr10第2249696位,其脱氧核苷酸为A;SNP43位于Chr10第2251882位,其脱氧核苷酸为G;SNP44位于Chr10第2252025位,其脱氧核苷酸为A;SNP45位于Chr10第2252206位,其脱氧核苷酸为T;SNP46位于Chr10第2252569位,其脱氧核苷酸为G;SNP47位于Chr10第2252834位,其脱氧核苷酸为A;SNP48位于Chr10第2252858位,其脱氧核苷酸为G;SNP49位于Chr10第2254501位,其脱氧核苷酸为C;SNP50位于Chr10第2435782位,其脱氧核苷酸为G;SNP51位于Chr10第2436054位,其脱氧核苷酸为G;SNP52位于Chr10第2447959位,其脱氧核苷酸为T;SNP53位于Chr10第2448243位,其脱氧核苷酸为A;SNP54位于Chr10第2448413位,其脱氧核苷酸为G;SNP55位于Chr10第2448663位,其脱氧核苷酸为C;SNP56位于Chr10第2449249位,其脱氧核苷酸为A;SNP57位于Chr10第2449442位,其脱氧核苷酸为C;SNP58位于Chr10第2449445位,其脱氧核苷酸为T;SNP59位于Chr10第2458185位,其脱氧核苷酸为G;SNP60位于Chr10第2458268位,其脱氧核苷酸为G;SNP61位于Chr10第2458966位,其脱氧核苷酸为A;SNP62位于Chr10第2459417位,其脱氧核苷酸为G;SNP63位于Chr10第2459522位,其脱氧核苷酸为A;SNP64位于Chr10第2460112位,其脱氧核苷酸为C;SNP65位于Chr10第2460136位,其脱氧核苷酸为C;SNP66位于Chr10第2460176位,其脱氧核苷酸为T;SNP67位于Chr10第2460184位,其脱氧核苷酸为G;SNP68位于Chr10第2460186位,其脱氧核苷酸为T;SNP69位于Chr10第2460504位,其脱氧核苷酸为G;SNP70位于Chr10第2460544位,其脱氧核苷酸为A;SNP71位于Chr10第2460798位,其脱氧核苷酸为G;SNP72位于Chr10第2460828位,其脱氧核苷酸为A;SNP73位于Chr10第2460912位,其脱氧核苷酸为T;SNP74位于Chr10第2460975位,其脱氧核苷酸为C;SNP75位于Chr10第2479832位,其脱氧核苷酸为C;SNP76位于Chr10第2480235位,其脱氧核苷酸为T;SNP77位于Chr10第2480292位,其脱氧核苷酸为G;SNP78位于Chr10第2648329位,其脱氧核苷酸为G;SNP79位于Chr10第2648366位,其脱氧核苷酸为G;SNP80位于Chr10第2648370位,其脱氧核苷酸为G;SNP81位于Chr10第2648385位,其脱氧核苷酸为T;SNP82位于Chr10第2648388位,其脱氧核苷酸为C;SNP83位于Chr10第2649934位,其脱氧核苷酸为G;SNP84位于Chr10第2655543位,其脱氧核苷酸为G;SNP85位于Chr10第2659077位,其脱氧核苷酸为A;SNP86位于Chr10第2799537位,其脱氧核苷酸为C;SNP87位于Chr10第2799564位,其脱氧核苷酸为G;SNP88位于Chr10第2799984位,其脱氧核苷酸为C;SNP89位于Chr10第2799985位,其脱氧核苷酸为A;SNP90位于Chr10第2799988位,其脱氧核苷酸为C;SNP91位于Chr10第2799991位,其脱氧核苷酸为T;SNP92位于Chr10第2837317位,其脱氧核苷酸为C;SNP93位于Chr10第2837433位,其脱氧核苷酸为C;SNP94位于Chr10第2838063位,其脱氧核苷酸为G;SNP95位于Chr10第2838303位,其脱氧核苷酸为G;SNP96位于Chr10第2838517位,其脱氧核苷酸为C;SNP97位于Chr10第2838991位,其脱氧核苷酸为T;SNP98位于Chr10第2839328位,其脱氧核苷酸为G;SNP99位于Chr10第2987358位,其脱氧核苷酸为T;SNP100位于Chr10第2987388位,其脱氧核苷酸为A;SNP101位于Chr10第2987536位,其脱氧核苷酸为G;SNP102位于Chr10第2987576位,其脱氧核苷酸为T;SNP103位于Chr10第2987588位,其脱氧核苷酸为C;SNP104位于Chr10第2987598位,其脱氧核苷酸为C;SNP105位于Chr10第2987601位,其脱氧核苷酸为T;SNP106位于Chr10第2988344位,其脱氧核苷酸为A;SNP107位于Chr10第2990821位,其脱氧核苷酸为G;SNP108位于Chr10第2991252位,其脱氧核苷酸为T;SNP109位于Chr10第2991301位,其脱氧核苷酸为C;所述SNP位点的物理位置是基于B73的全基因组序列V2版本确定。
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