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申请/专利权人：中国科学院微生物研究所
摘要：本发明公开了一种菌群定量丰度分析的方法。本发明方法包括：从不同样本中分别提取总DNA；针对不同样本的总DNA，一方面通过高通量测序得到待测菌群中全部或部分物种的相对丰度，另一方面通过qPCR测定所述待测菌群的总菌含量并进行归一化处理得到不同样本的含菌量系数；将高通量测序所得相对丰度结果中表示所述待测菌群的总菌含量的100％替换为qPCR所得不同样本的含菌量系数，从而得到所述待测菌群中全部或部分物种在不同样本间的丰度变化。本发明方法将不同样本菌群的含菌量与物种相对丰度结合从而获得不同样本菌群的定量分析结果，能够更加真实地反映某一类群细菌在不同样本间的丰度变化。
主权项：1.一种检测不同样本间携带的待测菌群中全部或部分物种的丰度变化的方法，包括如下步骤：A1从不同样本中分别提取总DNA；A2针对不同样本，分别将A1所得总DNA进行高通量测序，所述高通量测序为针对所述待测菌群的条形码基因测序，得到各样本所携带的所述待测菌群中全部或部分物种的相对丰度；A3针对不同样本，分别以A1所得总DNA为模板采用所述待测菌群的通用引物对进行qPCR，得到各样本所携带的所述待测菌群的总菌含量；将其中一个样本的总菌含量归一，得到其他样本的含菌量系数；A4针对不同样本，将A2所得结果中表示所述待测菌群的总菌含量的100％替换为A3所得的含菌量系数，从而得到不同样本间携带的所述待测菌群中全部或部分物种的丰度变化；所述待测菌群为宿主相关细菌群落和或真菌群落。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中国科学院微生物研究所 一种菌群定量丰度分析的方法
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