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通过分区中条码珠共定位生成核苷酸序列 

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申请/专利权人:生物辐射实验室股份有限公司

摘要:本申请涉及通过分区中条码珠共定位生成核苷酸序列。比较来自根据基于分区的条码化进行的测序的共有测序读数可以用于改善测序结果。增加各分区条码的负载也可以改善测序结果。

主权项:1.一种从来自细胞的DNA生成DNA模板核苷酸序列的方法,所述方法包括:a将所述DNA与转座酶接触,所述转座酶切割DNA样品中的DNA以形成DNA片段并将衔接子序列引入所述DNA片段的末端,以形成衔接子修饰的DNA片段;b将所述衔接子修饰的DNA片段划分成多个包含颗粒的分区,所述颗粒包含固体支持物表面,所述固体支持物表面上偶联多个寡核苷酸引物,其中所述寡核苷酸引物包含条码序列,并且其中不同颗粒之间的区别在于具有彼此不同的条码,其中至少一些分区具有超过一个颗粒分区,并且其中不同的颗粒偶联具有不同条码序列的引物;c在所述分区中,扩增所述衔接子修饰的DNA片段以形成衔接子修饰的DNA片段扩增子并将来自所述固体支持物的寡核苷酸引物与所述衔接子修饰的DNA片段扩增子连接,从而形成条码化衔接子修饰的DNA片段扩增子;d组合来自多个分区的条码化衔接子修饰的DNA片段扩增子;e生成所述条码化衔接子修饰的DNA片段扩增子的多个测序读数;f以成对的方式确定不同条码之间共有的相同DNA片段序列的测序读数的百分比;g将确定的不同条码之间共有的相同DNA片段序列的百分比与阈值进行比较,其中如果两个条码确定的共有的相同DNA片段序列的百分比高于所述阈值,那么确定所述两个条码处于同一分区中;和h由所述多个测序读数生成所述DNA模板的核苷酸序列,其中生成所述核苷酸序列包括将具有确定处于同一分区的不同条码的测序读数视为来自同一分区;从而生成DNA模板的核苷酸序列。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 生物辐射实验室股份有限公司 通过分区中条码珠共定位生成核苷酸序列

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