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申请/专利权人：福建医科大学附属第一医院

摘要：本发明提供了一种口腔鳞状细胞癌唾液菌群组合标志物及其筛选方法和应用，涉及口腔鳞状细胞癌生物标志物技术领域。本发明通过对口腔鳞状细胞癌患者和健康个体的唾液菌群进行宏基因组测序分析，基于群落多样性分析、物种组成差异分析，展示了口腔鳞状细胞癌的唾液菌群特征；并通过3种特征筛选策略以及6种机器学习模型寻找诊断口腔鳞状细胞癌发病风险的唾液菌种中水平生物标志物的最佳组合，最终确定了基于Boruta‑Catboost模型的43个唾液菌种水平标志物，可作为口腔鳞状细胞癌的一种新型方便、无创性辅助诊断生物标志物，具有良好的应用前景和现实意义。

主权项：1.唾液菌群组合标志物在制备辅助诊断口腔鳞状细胞癌产品中的应用，其特征在于，所述唾液菌群组合标志物包括缺陷乏养菌Abiotrophiadefectiva、发酵氨基酸球菌Acidaminococcusfermentans、豪氏放线菌Actinomyceshowellii、简氏气单胞菌Aeromonasjandaei、延长布劳特氏菌Blautiaproducta、土龟弯曲杆菌Campylobactergeochelonis、生痰二氧化碳噬纤维菌Capnocytophagasputigena、马氏棒杆菌Corynebacteriummatruchotii、粪肠球菌Enterococcusfaecalis、弗氏埃希氏菌Escherichiafergusonii、溶血孪生球菌Gemellahaemolysans、溶血嗜血杆菌Haemophilushaemolyticus、嗜血杆菌属口腔分类群036Haemophilussp.oraltaxon036、蜂房哈夫尼菌Hafniaalvei、纤毛菌属口腔分类群498Leptotrichiasp.oraltaxon498、沉积物海岸弯杆状菌Litorilituussediminis、解酪蛋白巨大球菌Macrococcuscaseolyticus、震颤杆菌属NSJ62Oscillibactersp.NSJ62、多杀巴斯德杆菌Pasteurellamultocida、北极星薯坚固杆菌Pectobacteriumpolaris、食木聚糖假丁酸弧菌Pseudobutyrivibrioxylanivorans、阴城假单胞菌Pseudomonasumsongensis、茄科罗尔斯通氏菌Ralstoniasolanacearum、啮齿杆菌属DSM111151Rodentibactersp.DSM111151、肠沙门氏菌Salmonellaenterica、月形单胞菌属口腔分类群136Selenomonassp.oraltaxon136、月形单胞菌属口腔分类群478Selenomonassp.oraltaxon478、武浦湿地螺状菌Spirosomarigui、金黄色葡萄球菌Staphylococcusaureus、光州链球菌Streptococcusgwangjuense、喜马拉雅链球菌Streptococcushimalayensis、缓症链球菌Streptococcusmitis、口腔链球菌Streptococcusoralis、肺炎链球菌Streptococcuspneumoniae、假肺炎链球菌Streptococcuspseudopneumoniae、链球菌属116-D4Streptococcussp.116-D4、链球菌属DAT741Streptococcussp.DAT741、链球菌属FDAARGOS-192Streptococcussp.FDAARGOS-192、脱氮硫胞菌Sulfuricelladenitrificans、坦纳氏菌属口腔分类群HOT-286Tannerellasp.oraltaxonHOT-286、运动硫黄色球菌Thioflavicoccusmobilis、中泽氏韦荣氏球菌Veillonellanakazawae、创伤弧菌Vibriovulnificus。

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