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申请/专利权人:笑纳科技(苏州)有限公司
摘要:本发明公开了一种FISH显微图像细胞分割方法,涉及图像识别技术领域;其包括步骤S1获得预处理后的灰度图像;步骤S2获得二值化图像;步骤S3获得初始细胞轮廓图像;步骤S4获得轮廓过滤后的细胞轮廓图像;步骤S5转化膨胀腐蚀后的二值化图像并获得距离权重图;步骤S6获得圆形标签区域图;步骤S7从含有待分割细胞轮廓的图像中获得非零像素点,将每一个非零像素点归类到细胞内接圆列表中的一个圆形中,获得聚类分割后的细胞轮廓图像;步骤S8获得每一轮廓线的近圆率,获得近圆率的所有轮廓线,形成二次过滤后的细胞轮廓图像;其通过步骤S4、步骤S5、步骤S7和步骤S8,使得显微图像中细胞分割快速且准确。
主权项:1.一种FISH显微图像细胞分割方法,其特征在于:包括如下步骤,步骤S1:获得显微图像的原始灰度图像,图像预处理,获得预处理后的灰度图像;步骤S2:用固定阈值分割预处理后的灰度图像,获得二值化图像Binaryraw;步骤S3:基于二值化图像Binaryraw,用轮廓提取算法提取获得细胞的轮廓线,获得初始细胞轮廓图像Contoursraw;步骤S4:计算初始细胞轮廓图像Contoursraw中每一个轮廓线的面积,获得每一轮廓面积,基于1000像素轮廓面积S5000像素,获得轮廓过滤后的细胞轮廓图像;步骤S5:对二值化图像Binaryraw进行膨胀和腐蚀,获得膨胀腐蚀后的二值化图像,基于膨胀腐蚀后的二值化图像计算每一前景像素到最近的背景像素的距离,转化膨胀腐蚀后的二值化图像并获得距离权重图Distdilation;步骤S6:基于距离权重图Distdilation,定位细胞位置和大小,获得圆形标签区域图Imagetag;步骤S7:基于圆形标签区域图Imagetag,从二值化图像Binaryraw中提取获得含有待分割细胞轮廓的图像;从含有待分割细胞轮廓的图像中获得非零像素点Px,y,将每一个非零像素点Px,y归类到细胞内接圆列表Listcircles中的一个圆形中,获得聚类分割后的细胞轮廓图像;步骤S8:基于聚类分割后的细胞轮廓图像,获得聚类分割后的细胞轮廓图像中每一轮廓线的近圆率Ratio,获得近圆率Ratio0.7的所有轮廓线,形成二次过滤后的细胞轮廓图像。
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