买专利卖专利找龙图腾，真高效！ 查专利查商标用IPTOP,全免费！专利年费监控用IP管家,真方便！

申请/专利权人：中国医学科学院药用植物研究所

摘要：本申请公开了一种基于时珍法的大黄鉴定方法及应用，其中，利用中药基原物种的核、叶绿体和线粒体基因组得到标准特异性靶标序列，从而能够基于所述标准特异性靶标序列实现对待检测样品的物种鉴定。时珍法可筛选获得判定任意待检测中药样品与指定中药基原物种同一性的标准特异性靶标序列，消除了脱靶等失误风险，由此，时珍法可准确判定任意待检测中药样品与指定中药基原物种的同一性。

主权项：1.一种基于时珍法的大黄鉴定方法，包括：1通过构建基因组图谱或浅层测序获得中药基原物种的核、叶绿体和线粒体基因组序列，将所述中药基原物种的核、叶绿体和线粒体基因组序列分成L-K+1个长度为K的片段，以构建所述小片段基因组文库，并计算每个片段的拷贝数，再通过与基因组比对确定每个片段的基因组位置，其中L表示基因组序列长度，K表示文库片段长度，其中，K为18-30bp，所述中药基原物种为掌叶大黄、唐古特大黄或药用大黄；2根据Taqmanprobe-basedreal-timePCR系统从所述小片段基因组文库中提取候选靶标序列并进行分析，从所述候选靶标序列中筛选符合如下筛选条件的候选序列作为标准特异性靶标序列，所述筛选条件包括：候选序列及扩增候选序列所在区域的引物中的G+C含量为30％-80％；根据候选序列设计的荧光探针与上下游扩增候选序列所在区域的引物退火温度分别为55℃-60℃以及68℃-70℃，且引物对间退火温度相差不超过2℃；候选序列及扩增候选序列所在区域的引物长度为15-30bp；上下游扩增候选序列所在区域的引物间隔50-150bp且正向引物靠近根据候选序列设计的荧光探针；根据候选序列设计的荧光探针与上下游扩增候选序列所在区域的引物不含发卡结构且引物对不能形成二聚体；上下游扩增候选序列所在区域的引物3'端5bp内GC碱基不超过两个；根据候选序列设计的荧光探针中的C碱基多于G碱基；和或候选序列与混伪品及近缘物种的核、叶绿体和线粒体基因组进行比对至少含有2个差异核苷酸；3提取待检测中药样品的基因组DNA，任选地对其进行扩增，将所述基因组DNA或其扩增产物作为DNA底物，利用靶标序列检测系统来检测所述DNA底物中是否存在所述标准特异性靶标序列，其中，所述靶标序列检测系统Taqmanprobe-basedreal-timePCR系统通过所述检测若CT值大于37，则所述待检测中药样品与指定的中药基原物种具有同一性，反之则没有。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 中国医学科学院药用植物研究所 基于时珍法的中药鉴定方法及应用