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申请/专利权人：重庆大学
申请日：2024-04-25
公开（公告）日：2024-06-28
公开（公告）号：CN118262784A
主分类号：G16B15/30
分类号：G16B15/30;G16B40/00;G06N3/0464;G06N3/045;G06F18/25
优先权：
专利状态码：在审-公开
法律状态：2024.06.28#公开
摘要：本发明涉及一种基于跨尺度与跨模态注意力机制的药物‑靶标结合亲和力预测方法，属于药物研发领域。该方法包括：输入的药物和靶蛋白分别由基于多元卷积核的特征提取模块提取得到三个尺度的特征，相互作用模块根据药物和靶蛋白两个不同尺度的特征分别得到具有关键信息的药物特征和靶蛋白特征，药物‑靶标相互作用模块基于具有关键信息的药物特征和靶蛋白特征提取包含关键结合位点的特征；通过基于多元卷积核的特征提取模块、基于跨尺度注意力的相互作用模块和基于跨模态注意力的药物‑靶标相互作用模块获得了包含生物学信息的特征，并由回归模块基于包含生物学信息的药物特征和靶蛋白特征对药物‑靶标的结合亲和力值进行预测。
主权项：1.一种基于跨尺度与跨模态注意力机制的药物-靶标结合亲和力预测方法，其特征在于：其包括以下步骤：S1、对待预测的药物和靶蛋白进行预处理，其中，将氨基酸序列形式的靶蛋白中的氨基酸序列编码为数字，将SMILES字符串形式的药物中的SMILES字符串编码为数字；S2、将预处理后的药物和靶蛋白信息分别输入至预测方法的基于多元卷积核的特征提取模块，分别提取得到药物和靶蛋白的三个尺度的特征；S3、将药物和靶蛋白的两个尺度的特征输入基于跨尺度注意力的相互作用模块，由基于跨尺度注意力的相互作用模块结合注意力机制得到具有关键信息的药物特征和靶蛋白特征；S4、将具有关键信息的药物特征和靶蛋白特征输入基于跨模态注意力的药物-靶标相互作用模块，由基于跨模态注意力的药物-靶标相互作用模块结合注意力机制提取得到包含关键结合位点的特征；S5、通过基于多元卷积核的特征提取模块、基于跨尺度注意力的相互作用模块和基于跨模态注意力的药物-靶标相互作用模块获得了包含生物学信息的特征，将包含生物学信息的药物特征和靶蛋白特征输入至回归模块，由回归模块通过三个全连接操作预测药物-靶标的结合亲和力。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 重庆大学 基于跨尺度与跨模态注意力机制的药物-靶标结合亲和力预测方法
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