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一种合成致死基因组合的预测方法及系统 

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申请/专利权人:南京邮电大学

摘要:本发明公开了一种合成致死基因组合的预测方法及系统,1集中预测方法包括获取基因组合;基于双尾Wilcoxon秩和检验和Spearman相关性分析,利用基因组合获得基因组合的第一特征;基于igraph包的相关函数,利用基因组合获得基因组合的第二特征;基于GO语义相似性,利用基因组合评估基因组合的基因间的细胞组成、分子功能以及生物过程相似性,以获得基因组合的第三特征;基于OCSVM模型,利用基因组合和基因组合的各特征确定基因组合是否具有合成致死相互作用,以预测所述基因组合是否为合成致死基因组合;其中,igraph包的相关函数包括closeness、eccentricity以及page.rank。本发明能够预测基因组合是否为合成致死基因组合。

主权项:1.一种合成致死基因组合的预测方法,其特征在于,包括以下步骤:获取基因组合;基于双尾Wilcoxon秩和检验和Spearman相关性分析,利用基因组合获得基因组合的第一特征;基于igraph包的相关函数,利用基因组合获得基因组合的第二特征;基于GO语义相似性,利用基因组合评估基因组合的基因间的细胞组成、分子功能以及生物过程相似性,以获得基因组合的第三特征;基于OCSVM模型,利用基因组合和基因组合的各特征确定基因组合是否具有合成致死相互作用,以预测所述基因组合是否为合成致死基因组合;其中,igraph包的相关函数包括closeness、eccentricity以及page.rank。

全文数据:

权利要求:

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