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申请/专利权人：宋清
摘要：本发明公开了各人种单倍型祖源数据库的构建方法，步骤包括：大小不同的提取框从各人种的单倍型序列提取信息，并标记人种信息；比对同一人种内SNP位点相同的片段，将SNP位点相同且SNP位点上碱基信息相同的片段进行合并；比对各人种间SNP位点相同的片段，找出SNP位点相同且SNP位点上碱基信息相同的片段，标记其对应的所有人种信息。本发明优点有：同一单倍型的遗传信息在不同SNP位点数量的片段中储存，利于待测单倍型比对；SNP位点相同且SNP位点碱基信息相同的片段均标记其对应的所有人种信息，避免在查找疾病关联基因时受到祖源信息不全的干扰而影响准确性。
主权项：1.各人种单倍型祖源数据库的构建方法，其特征在于：步骤包括：1收集各人种的全基因组数据，以单个单倍型序列为样本单位；2设置提取框，所述提取框从单倍型序列的一端向另一端移动并提取位于所述提取框内片段的SNP信息，并将每个所述片段标记对应的人种信息，同一人种内的片段按每个片段最接近5’端或3’端的SNP位点先后将每个片段按序暂存，直到每个人种的每个单倍型序列的SNP信息均被提取完毕；所述提取框从单倍型序列的一端向另一端移动是逐个SNP移动的；所述提取框从单倍型序列的5’端向3’端移动或从单倍型序列的3’端向5’端移动；所述提取框的大小是能够提取10-200个连续SNP；步骤2中，有2个以上不同大小的提取框移动提取同一个单倍型序列的SNP信息，直到每个人种的每个单倍型序列的SNP信息均被每个提取框移动提取完毕；3比对同一人种内SNP位点相同的片段，将SNP位点相同且SNP位点上碱基信息相同的片段进行合并；4比对各人种间SNP位点相同的片段，找出SNP位点相同且SNP位点上碱基信息相同的片段，标记其对应的所有人种信息。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 宋清 各人种单倍型祖源数据库的构建方法
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