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申请/专利权人:云南省农业科学院质量标准与检测技术研究所
摘要:本发明是一种香石竹品种鉴定的特异性SNP分子标记组合及应用,特异性SNP分子标记组合包括30个位点DSNP001~DSNP030,通过设计特异性引物进行SNP位点扩增,根据突变类型的分型结果实现香石竹品种快速鉴定。本发明的技术方案采用目前国际国内品种鉴定领域均认可的SNP标记技术,以基于KASP技术的多种荧光扫描平台如GeneMatrix、LGC‑SNPline、DouglasArrayTape等平台为主,与基于田间试验的品种鉴定技术相比不受环境影响和季节约束;与SSR分子标记相比检测通量高、数据统计分析简单、数据兼容性强、易实现数据共享,弥补了目前缺少香石竹品种鉴定技术方法的空白,实现了香石竹DNA指纹图谱构建、香石竹品种快速鉴定、对未知品种进行鉴定或者分子育种辅助。
主权项:1.香石竹品种鉴定的特异性SNP分子标记组合,其特征在于,所述特异性SNP分子标记组合包括30个位点DSNP001~DSNP030,具体为:DSNP001位于1号染色体上第7693484位,其脱氧核苷酸为T或G;DSNP002位于1号染色体上第585842位,其脱氧核苷酸为T或C;DSNP003位于2号染色体上第39830424位,其脱氧核苷酸为C或T;DSNP004位于2号染色体上第5188873位,其脱氧核苷酸为G或A;DSNP005位于2号染色体上第9629855位,其脱氧核苷酸为G或A;DSNP006位于3号染色体上第37862405位,其脱氧核苷酸为G或A;DSNP007位于3号染色体上第40176043位,其脱氧核苷酸为A或G;DSNP008位于4号染色体上第11960641位,其脱氧核苷酸为C或T;DSNP009位于4号染色体上第14870858位,其脱氧核苷酸为A或G;DSNP010位于4号染色体上第33129807位,其脱氧核苷酸为A或G;DSNP011位于5号染色体上第38158253位,其脱氧核苷酸为G或A;DSNP012位于6号染色体上第35657747位,其脱氧核苷酸为C或T;DSNP013位于6号染色体上第703572位,其脱氧核苷酸为A或G;DSNP014位于7号染色体上第19380970位,其脱氧核苷酸为C或T;DSNP015位于7号染色体上第4186644位,其脱氧核苷酸为A或G;DSNP016位于8号染色体上第3043420位,其脱氧核苷酸为T或G;DSNP017位于8号染色体上第3573497位,其脱氧核苷酸为A或T;DSNP018位于8号染色体上第38051647位,其脱氧核苷酸为G或C;DSNP019位于9号染色体上第11827432位,其脱氧核苷酸为G或C;DSNP020位于10号染色体上第194270位,其脱氧核苷酸为A或C;DSNP021位于10号染色体上第2424784位,其脱氧核苷酸为G或A;DSNP022位于11号染色体上第33705004位,其脱氧核苷酸为A或T;DSNP023位于11号染色体上第34096633位,其脱氧核苷酸为G或C;DSNP024位于12号染色体上第34793864位,其脱氧核苷酸为C或A;DSNP025位于13号染色体上第19425592位,其脱氧核苷酸为T或C;DSNP026位于13号染色体上第33938977位,其脱氧核苷酸为C或A;DSNP027位于14号染色体上第26987170位,其脱氧核苷酸为T或C;DSNP028位于14号染色体上第29804474位,其脱氧核苷酸为G或A;DSNP029位于15号染色体上第17208330位,其脱氧核苷酸为A或G;DSNP030位于15号染色体上第24408485位,其脱氧核苷酸为A或G。
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百度查询: 云南省农业科学院质量标准与检测技术研究所 香石竹品种鉴定的特异性SNP分子标记组合及应用
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