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来自中棉所70群体中能提高棉花纤维强度的SNP标记 

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申请/专利权人:中国农业科学院棉花研究所

摘要:本发明属于棉花分子育种技术领域,公开了来自中棉所70群体中能提高棉花纤维强度的SNP标记。所述的SNP分子标记是以棉花稳定的RIL群体为材料,通过简化基因组测序的方法得到。利用本发明所公开的这些标记位点,进行快速纤维高强材料的筛选,可大大缩短育种周期,提高棉花纤维强度的育种效率。

主权项:1.一种与陆地棉纤维品质基因连锁的SNP分子标记的筛选方法,包括如下步骤:1利用大田推广的陆地棉栽培品种sGK156系901-001系杂交获得杂交种中棉所70F1,并构建了F2和F2:3群体;2F2:3群体家系内每世代自交,在F2:5世代进行一次单株选择,再种植两代到F5:7,把F5:7及以后的世代作为重组自交系群体进行多年多点实验;3提取重组自交系群体和亲本的基因组DNA;4对检测的各样品基因组DNA进行SLAF测序,构建连锁图谱;5纤维强度性状QTL定位:通过9个环境下稳定的纤维品质主效QTLs筛选,选择与纤维强度、纤维长度、马克隆值分型明显的SNP分子标记,得到4个在多环境下稳定纤维强度主效的QTL和1个在多环境下稳定的马克隆值主效的QTL,及其连锁的SNP分子标记;其中,4个在多环境下稳定纤维强度主效的QTL连锁的SNP分子标记在染色体上的位置和突变碱基如下表所示,参考基因组的版本号为张天真的三代基因组版本TM-1v2.1; SNP QTL Alleles position D01_58256867 qFS-chr15-4 CT 58256867 D13_56413025 qFS-chr18-4 CT 56413025 D13_64214162 qFS-chr18-1 TC 64214162 D13_64376711 qFS-chr18-1 AG 64376711 。

全文数据:

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