首页 专利交易 科技果 科技人才 科技服务 国际服务 商标交易 会员权益 IP管家助手 需求市场 关于龙图腾
 /  免费注册
到顶部 到底部
清空 搜索

通过靶向PRDM15的反义寡核苷酸治疗癌症的方法 

买专利卖专利找龙图腾,真高效! 查专利查商标用IPTOP,全免费!专利年费监控用IP管家,真方便!

申请/专利权人:新加坡科技研究局

摘要:本发明涉及用于调节PRDM15活性的反义寡核苷酸及其在治疗癌症中的用途。特别地,所述反义寡核苷酸能够诱导PRDM15mRNA的外显子跳读。本发明还涉及通过评估样品中PRDM15核酸、蛋白质或活性的水平来确定癌症患者的预后或为癌症患者选择治疗策略的方法。

主权项:1.一种经分离的反义寡核苷酸,其用于通过诱导PRDM15前体mRNA或成熟mRNA的外显子跳读来抑制PRDM15的表达从而诱导细胞周期停滞或凋亡,其中所述反义寡核苷酸为选自SEQIDNO:18、19、21、26、27、36、70、71、72和73中任一个的序列,与PRDM15前体mRNA或成熟mRNA的靶区域特异性杂交。

全文数据:通过靶向PRDM15的反义寡核苷酸治疗癌症的方法本发明涉及反义寡核苷酸。特别地,本发明涉及能够诱导RNA外显子跳读的反义寡核苷酸。更具体地,本申请涉及癌症领域,特别是涉及过表达含有PR结构域的蛋白质15PRDM15的癌症的领域,例如淋巴瘤[滤泡性淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤]、胶质母细胞瘤、乳腺癌、前列腺癌、肺癌和结肠癌等。本文显示,PRMD15蛋白质丰度的直接和选择性靶向[例如,通过反义寡核苷酸ASO介导的外显子跳读]导致细胞周期停滞和癌细胞凋亡。还提供了证据证明,正常组织中PRDM15的完全缺失[例如通过基因缺失]或部分缺失[例如通过反义寡核苷酸ASO介导的外显子跳读]不产生不利影响。PRDM蛋白家族分别在小鼠和人中包含16个和17个成员。所有PRDM都具有共同的结构域结构,在N-末端具有PR结构域,在C-末端具有许多C2H2锌指1。后者可能涉及序列特异性DNA结合并对核定位至关重要2,3。PR结构域在功能和结构上与SET[Suvar3-9,zeste增强子[Ez]和TrithoraxTrx]结构域相关,该SET结构域是蛋白赖氨酸甲基转移酶KMT的催化结构域4。实际上,与SET结构域相似,一些但非全部PR结构域已经显示出具有直接使赖氨酸残基甲基化的内在催化活性5-11。PRDM2是被证实为肿瘤抑制因子的第一个PRDM家族成员。最初鉴定为RB相互作用蛋白,随后报道了含有PRDM2的基因组基因座Chr.1p36在多种癌症类型中经常缺失重排12-14。其他PRDM基因显示相似的模式例如PRDM16q21-q22.1和PRDM412q23-q24.115。PRDM1确实是DLBCL和其他血液肿瘤中已确定的肿瘤抑制因子16。其在ABC活化的B细胞样-DLBCL中的表达通常通过多种遗传和表观遗传机制被沉默17-19。从机制上讲,PRDM1缺失阻止B细胞终末分化并增加其增殖能力20。相反,其过表达诱导DLBCL细胞中的G1细胞周期停滞。该家族的另一成员PRDM9的罕见等位基因变体通常仅在生殖细胞中表达,最近已与B细胞前体急性淋巴细胞白血病B-ALL相关联21,22,而PRDM11显示作为Eμ-MycB细胞淋巴瘤小鼠模型系统中的肿瘤抑制因子23。PRDM15是该家族中未充分表征的成员,其以高水平与正常组织相比在滤泡和DLBCL淋巴瘤中表达24。选择性且有效靶向任何PRDM家族成员的小分子抑制剂迄今尚未被鉴定引入临床。在本说明书中列出或讨论的明显在先公开的文件不应被视为承认该文件是现有技术的一部分或是公知常识。本文提及的任何文件均通过引用整体并入本文。本申请涉及癌症领域,特别涉及过表达含有PR结构域的蛋白质15PRDM15的癌症,例如淋巴瘤[滤泡性淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤]、胶质母细胞瘤、乳腺癌、前列腺癌、肺癌和结肠癌等。本文示出了PRMD15蛋白质丰度的直接和选择性靶向[例如,通过反义寡核苷酸ASO介导的外显子跳读]导致细胞周期停滞和癌细胞凋亡。还提供了证据证明,正常组织中PRDM15的完全缺失[例如通过基因缺失]或部分缺失[例如通过反义寡核苷酸ASO介导的外显子跳读]不产生不利影响。在本发明的第一方面,提供了用于调节PRDM15活性的经分离的反义寡核苷酸。优选地,术语调节是指对PRDM15的活性;PRDM15的RNA剪接或翻译后加工;PRDM15的磷酸化;PRDM15的表达水平包括mRNA和或前体mRNA表达和蛋白质表达;或PRDM15的亚细胞定位中的一种或多于一种的激活、抑制、延迟、阻遏或干扰。优选地,在本发明中,寡核苷酸调节前体mRNA、成熟mRNA和蛋白质表达的活性或水平中的一种或多于一种。在各种实施方案中,寡核苷酸抑制PRDM15的表达或修饰其表达产物。在特定的实施方案中,寡核苷酸通过诱导PRDM15前体mRNA或成熟mRNA的外显子跳读来抑制PRDM15的表达,从而诱导细胞周期停滞或凋亡。更具体地,寡核苷酸抑制PRDM15在过表达PRDM15的细胞中的表达。优选地,寡核苷酸与PRDM15前体mRNA或成熟mRNA的靶区域特异性杂交。如本文所用,“杂交”是指根据沃森-克里克DNA互补性、Hoogstein结合、或本领域已知的其他序列特异性结合规则通过氢键在两条或三条核酸链之间的相互作用。杂交可以在本领域已知的不同的严格条件下进行。优选地,靶区域是选自以下的任何外显子、内含子或外显子-内含子边界:外显子8、外显子9、外显子11、外显子12、外显子15、外显子16、外显子17、外显子18、外显子21、外显子24、外显子25、外显子29、内含子7、内含子8、内含子11、内含子12、内含子14和内含子15。这些序列如表1所示。表1优选地,反义寡核苷酸包括选自SEQIDNO:1至SEQIDNO:73中任一个的序列。这些序列如表2所示。表2表2不仅示出了本发明的反义寡核苷酸的各种序列,还示出了表1中所示的各个靶外显子的序列。在本发明的各种实施方案中,表2中列出的每个序列可以靶向一个或多于一个外显子。例如SEQIDNO:69靶向外显子16、SEQIDNO:70至SEQIDNO:73靶向外显子17。“寡核苷酸”意指任何多核苷酸。“多核苷酸”是由核苷酸组成的寡聚体。多核苷酸可包括DNA、RNA、其修饰形式、或其组合。如本文所用的术语“核苷酸”可与本文所讨论的和本领域其他已知的修饰形式互换。在一些情况下,本领域使用术语“核碱基”,其包括可聚合的天然存在的核苷酸以及修饰的核苷酸。因此,核苷酸或核碱基是指天然存在的核碱基腺嘌呤A、核碱基鸟嘌呤G、核碱基胞嘧啶C、核碱基胸腺嘧啶T和核碱基尿嘧啶U以及非天然存在的核碱基,例如黄嘌呤、二氨基嘌呤、8-氧-N6-甲基腺嘌呤、7-脱氮黄嘌呤、7-脱氮鸟嘌呤、N4,N4-桥亚乙基胞嘧啶N4,N4-ethanocytosin、N',N'-桥亚乙基ethano-2,6-二氨基嘌呤、5-甲基胞嘧啶mC、5-C[3]-C6-炔基-胞嘧啶、5-氟尿嘧啶、5-溴尿嘧啶、假异胞嘧啶、2-羟基-5-甲基-4-三唑吡啶、异胞嘧啶、异鸟嘌呤、肌苷以及Benner等人美国专利第5432272号以及SusanM.Freier和Karl-HeinzAltmann,1997,NucleicAcidsResearch,第25卷:第4429页至第4443页描述的“非天然存在的”核碱基。术语“核碱基”不仅包括已知的嘌呤和嘧啶杂环,还包括其杂环类似物和互变异构体。其他天然和非天然存在的核碱基包括以下公开的那些:美国专利第3687808号Merigan等人,Sanghvi的第15章,AntisenseResearchandApplication,S.T.Crooke和B.Lebleu编辑,CRC出版社,1993,Englisch等人,1991,AngewandteChemie,国际版,30:613至722特别参见第622页和第623页,和theConciseEncyclopediaofPolymerScienceandEngineering,J.I.Kroschwitz编辑,JohnWiley和Sons,1990,第858页至第859页,Cook,Anti-CancerDrugDesign1991,6,585至607,其每一篇通过引用整体并入本文。在多个方面,多核苷酸还包括一个或多于一个“核苷碱基”或“碱基单元”,该“核苷碱基”或“碱基单元”包括可以像核碱基一样起作用的化合物例如杂环化合物,包括一些在最经典的意义上不是核苷碱基但是用作核苷碱基的“通用碱基”。通用碱基包括3-硝基吡咯、任选地经取代的吲哚例如5-硝基吲哚和任选地经取代的次黄嘌呤。其他所需的通用碱基包括吡咯和二唑或三唑衍生物,包括本领域已知的那些通用碱基。多核苷酸还可包括经修饰的核碱基。“经修饰的碱基”在本领域中被理解为可以与天然碱基例如腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶、尿嘧啶和或胸腺嘧啶配对和或可以与非天然存在的碱基配对的碱基。示例性的经修饰的碱基描述于EP1072679和WO9712896中,其公开内容通过引用并入本文。经修饰的核碱基包括但不限于5-甲基胞嘧啶5-me-C、5-羟甲基胞嘧啶、黄嘌呤、次黄嘌呤、2-氨基腺嘌呤、腺嘌呤和鸟嘌呤的6-甲基衍生物和其他烷基衍生物、腺嘌呤和鸟嘌呤的2-丙基衍生物和其他烷基衍生物、2-硫代尿嘧啶、2-硫代胸腺嘧啶和2-硫代胞嘧啶、5-卤代尿嘧啶和5-卤代胞嘧啶、5-丙炔基尿嘧啶和5-丙炔基胞嘧啶和嘧啶碱基的其他炔基衍生物、6-偶氮尿嘧啶、6-偶氮胞嘧啶和6-偶氮胸腺嘧啶、5-尿嘧啶假尿嘧啶、4-硫代尿嘧啶、8-卤代腺嘌呤和8-卤代鸟嘌呤、8-氨基腺嘌呤和8-氨基鸟嘌呤、8-巯基腺嘌呤和8-巯基鸟嘌呤、8-硫代烷基腺嘌呤和8-硫代烷基鸟嘌呤、8-羟基腺嘌呤和8-羟基鸟嘌呤以及其他8位取代的腺嘌呤和其他8位取代的鸟嘌呤、5-卤代尿嘧啶和5-卤代胞嘧啶特别是5-溴代尿嘧啶和5-溴代胞嘧啶、5-三氟甲基尿嘧啶和5-三氟甲基胞嘧啶和其他5位取代的尿嘧啶和其他5位取代的胞嘧啶、7-甲基鸟嘌呤和7-甲基腺嘌呤、2-F-腺嘌呤、2-氨基-腺嘌呤、8-氮杂鸟嘌呤和8-氮杂腺嘌呤、7-脱氮鸟嘌呤和7-脱氮腺嘌呤和3-脱氮鸟嘌呤和3-脱氮腺嘌呤。其他经修饰的碱基包括三环嘧啶例如吩噻嗪胞苷1H-嘧啶并[5,4-b][1,4]苯并嗪-23H-酮、吩噻嗪胞苷1H-嘧啶并[5,4-b][1,4-苯并噻嗪-23H-酮、G-钳G-clamp如经取代的吩噻嗪胞苷例如9-2-氨基乙氧基-H-嘧啶并[5,4-b][1,4]苯并唑-23H-酮、咔唑胞苷2H-嘧啶并[4,5-b]吲哚-2-酮、吡啶并吲哚胞苷H-吡啶并[3',2':4,5]吡咯并[2,3-d]嘧啶-2-酮。经修饰的碱基还可包括其中嘌呤或嘧啶碱基被其他杂环取代的那些,例如7-脱氮腺嘌呤、7-脱氮鸟嘌呤、2-氨基吡啶和2-吡啶酮。另外的核碱基包括美国专利第3687808号中公开的那些;TheConciseEncyclopediaOfPolymerScienceAndEngineering,第858页至第859页,Kroschwitz,J.I.编辑JohnWiley和Sons,1990中公开的那些;Englisch等人,1991,AngewandteChemie,国际版,30:613中公开的那些;以及Sanghvi,YS,第15章,AntisenseResearchandApplications,第289页至第302页,Crooke,ST和Lebleu,B.编辑,CRC出版社,1993中公开的那些。这些碱基中的一些碱基可用于增加多核苷酸的结合亲和力,这些碱基包括5位取代的嘧啶、6-氮杂嘧啶和N-2取代的嘌呤、N-6取代的嘌呤和O-6取代的嘌呤,包括2-氨基丙基腺嘌呤、5-丙炔基尿嘧啶和5-丙炔基胞嘧啶。已显示5-甲基胞嘧啶取代使核酸双链体稳定性增加0.6℃至1.2℃,并且在一些方面,5-甲基胞嘧啶取代与2'-O-甲氧基乙基糖修饰相组合。参见美国专利第3687808号、美国专利第4845205号、美国专利第5130302号、美国专利第5134066号、美国专利第5175273号、美国专利第5367066号、美国专利第5432272号、美国专利第5457187号、美国专利第5459255号、美国专利第5484908号、美国专利第5502177号、美国专利第5525711号、美国专利第5552540号、美国专利第5587469号、美国专利第5594121号、美国专利第5596091号、美国专利第5614617号、美国专利第5645985号、美国专利第5830653号、美国专利第5763588号、美国专利第6005096号、美国专利第5750692号和美国专利第5681941号,其公开内容通过引用并入本文。本领域技术人员可以根据本公开容易地设计反义多核苷酸。例如,本领域的一般教导包括但不限于Aartsma-Rus等人,MethodsMolBiol.867:117至1292012;Aartsma-Rus等人,MethodsMolBiol.867:97至1162012;vanRoon-Mom等人,MethodsMolBiol.867:79至962012,其中的每一个都通过引用并入本文。一般指导还包括试图避免3个连续的G或C核苷酸,选择有利于自身结构的长度和序列避免形成发夹,并避免那些可能形成引物二聚体的序列。在一些实施方案中,本公开的反义多核苷酸是被设计为与外显子或内含子或内含子-外显子边界特异性杂交的多核苷酸,以使得当反义多核苷酸与PRDM15核酸特异性杂交时,反义多核苷酸与完全在PRDM15核酸的外显子内的序列特异性杂交,或反义多核苷酸的约一个核苷酸跨越所述内含子-外显子边界。在反义多核苷酸与完全位于外显子内的序列特异性杂交的一些实施方案中,预期反义多核苷酸的末端为约1个、2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个、10个、或者多于10个来自外显子末端的核苷酸。在其他实施方案中,本公开内容的反义多核苷酸是被设计为与PRDM15核酸的内含子-外显子边界特异性杂交的多核苷酸,以使得约2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个、10个、或者多于10个反义多核苷酸的核苷酸跨越所述内含子-外显子边界。应理解,核苷酸可在外显子侧或内含子侧“跨越内含子-外显子边界”。因此,特异性地且主要地与内含子序列杂交且仅与相邻外显子的一个核苷酸杂交的反义多核苷酸“跨越内含子-外显子边界”一个核苷酸。类似地,与外显子序列特异性杂交且仅与相邻内含子的一个核苷酸杂交的反义多核苷酸“跨越内含子-外显子边界”一个核苷酸。在任何上述实施方案中,反义多核苷酸的长度为至少约10个核苷酸且至多约15个、20个、25个、30个、35个、40个、45个、50个或多于50个核苷酸。考虑使用经修饰的多核苷酸,其中多核苷酸中核苷酸单元的一个或多于一个糖和或一个或多于一个核苷酸间连接分别被“非天然存在的”糖即除核糖或脱氧核糖以外的糖或核苷酸间连接取代。在一个方面,该实施方案考虑了肽核酸PNA。在PNA化合物中,多核苷酸的糖骨架被含酰胺例如,N-2-氨基乙基-甘氨酸单元之间的肽键的主链取代。参见,例如,美国专利第5539082号、美国专利第5714331号、和美国专利第5719262号、和Nielsen等人,Science,1991,254,1497至1500,其公开内容通过引用并入本文。经修饰的多核苷酸还可含有一个或多于一个经取代的糖基。在一个方面,糖的修饰包括锁核酸LNA,其中2'-羟基与糖环的3'或4'碳原子连接,从而形成双环糖基。在一些方面,连接是桥连2'氧原子和4'碳原子的亚甲基-CH[2]-[n]基团,其中n是1或2。LNA及其制备描述于WO9839352和WO9914226中,其公开内容通过引用并入本文。在本发明中,优选地,反义寡核苷酸包括经修饰的多核苷酸主链。经修饰的多核苷酸主链包括至少一个多核苷酸的糖被取代的修饰部分。修饰部分可以选自磷酰二胺吗啉代寡聚物PMO、肽缀合的磷酰二胺吗啉代寡聚物PPMO和非肽树枝状聚合物八胍部分标记的吗啉代寡聚物。在各种实施方案中,经修饰的多核苷酸主链包括至少一个经修饰的核苷酸间连接。经修饰的核苷酸间连接包括经修饰的磷酸酯。更优选地,经修饰的磷酸酯选自非桥接氧原子被硫原子取代的磷酸酯、膦酸酯、硫代磷酸酯、磷酸二酯、吗啉磷酸酯phosphoromorpholidate、哌嗪磷酸酯和氨基磷酸酯。在本发明的各种实施方案中,反义寡核苷酸包括主链,该主链选自核糖核酸、脱氧核糖核酸、DNA硫代磷酸酯、RNA硫代磷酸酯、2'-O-甲基-寡核糖核苷酸和2'-O-甲基-寡脱氧核糖核苷酸、2'-O-烃基核糖核酸、2'-O-烃基DNA、2'-O-烃基RNA硫代磷酸酯、2'-O-烃基DNA硫代磷酸酯、2'-F-硫代磷酸酯、2'-F-磷酸二酯、2'-甲氧基乙基硫代磷酸酯、2-甲氧基乙基磷酸二酯、脱氧亚甲基甲基亚氨基脱氧MMI、2'-O-烃基MMI、脱氧甲基膦酸酯、2'-O-烃基甲基膦酸酯、吗啉代、4'-硫代DNA、4'-硫代RNA、肽核酸、3'-酰胺化物、脱氧3'-酰胺化物、2'-O-烃基3'-酰胺化物、锁核酸、环己烷核酸、三环-DNA、2'-氟-阿拉伯核酸、N3'-P5'氨基磷酸酯、氨基甲酸酯连接的主链、磷酸三酯连接的主链、尼龙改性的主链和前述主链的混合物。优选地,寡核苷酸与一种或多于一种缀合物化学连接,该缀合物增强反义寡核苷酸的活性、细胞分布或细胞摄取。本公开的化合物还可以用作预防剂或治疗剂,其可以用于治疗遗传疾病。在一个实施方案中,反义寡核苷酸可用于治疗表达PRDM15的癌症患者。可以给患者施用另外的抗癌剂或治疗。癌症是选自以下的任何一种:血液系统恶性肿瘤、肺癌、乳腺癌、前列腺癌、胃癌、睾丸癌、喉癌、肝癌、子宫癌、结肠直肠癌、黑色素瘤、胶质母细胞瘤、肉瘤和视网膜母细胞瘤。血液系统恶性肿瘤是淋巴瘤或白血病。特别地,淋巴瘤是B细胞淋巴瘤。更具体地,B细胞淋巴瘤是滤泡性淋巴瘤或弥漫性大B细胞淋巴瘤。在本发明的另一个方面,提供了药物组合物,其包含根据本发明第一方面的反义寡核苷酸和药学上可接受的载剂。该组合物适于单独地或与递送剂复合经胃肠外施用至患者。载剂选自纳米颗粒,例如聚合物纳米颗粒;脂质体,例如pH敏感性脂质体、抗体缀合脂质体;病毒载体,阳离子脂质,聚合物,UsnRNA例如U7snRNA以及细胞穿透肽。反义寡核苷酸经口、或经直肠、或经黏膜、或经肠、或肌内、或皮下、或髓内、或鞘内、或直接心室内、或静脉内、或玻璃体内、或腹膜内、或鼻内、或眼内施用。药学上可接受的载剂通常是指适合施用于对象的材料,其中载剂是生物学上无害的,否则产生不良作用。这些载剂通常是药物的惰性成分。通常,载剂与活性成分一起施用于对象,而不会引起任何不期望的生物学效果或不以有害的方式与包含它的药物组合物的任何其他组分相互作用。合适的药物载剂描述于Martin,Remington的PharmaceuticalSciences,第18版,MackPublishingCo.,Easton,Pa.,1990中,其全部内容通过引用并入本文。在本公开的更具体形式中提供了药物组合物,其包含治疗有效量的反义多核苷酸以及药学上可接受的稀释剂、防腐剂、增溶剂、乳化剂、佐剂和或载剂。这些组合物包含稀释剂,该稀释剂具有各种缓冲剂内容物例如,磷酸盐、Tris-HCl、乙酸盐、pH和离子强度以及添加剂,例如表面活性剂和增溶剂例如吐温80、聚山梨醇酯80、抗氧化剂例如抗坏血酸、偏亚硫酸氢钠、防腐剂例如,硫柳汞、苯甲醇和膨胀物质例如乳糖、甘露醇。该材料可以掺入聚合化合物的颗粒制剂中,例如但不限于聚乳酸或聚羟基乙酸,或掺入脂质体中。也可以使用透明质酸。这些组合物可影响所公开组合物的物理状态、稳定性、体内释放速率和体内清除速率。组合物可以以液体形式制备,或者可以以干燥粉末例如冻干形式制备。应当理解,根据本公开提供的药物组合物可以通过本领域已知的任何方式施用。优选地,施用的药物组合物通过注射、经口或通过肺部或鼻部途径施用。在各种实施方案中,反义多核苷酸通过静脉内、动脉内、腹膜内、肌内或皮下施用途径来递送。本发明的反义分子包括任何药学上可接受的盐、酯、或这些酯的盐、或任何其它化合物,其在施用于包括人在内的动物后能够直接或间接提供其生物活性代谢物或残留物。因此,例如,本公开还涉及本发明化合物的前药和药学上可接受的盐、这些前药的药学上可接受的盐、和其他生物等效物。术语“药学上可接受的盐”是指本发明化合物的生理学上和药学上可接受的盐:即,保留母体化合物所需的生物活性并且不赋予母体化合物不需要的毒理学作用的盐。对于多核苷酸,药学上可接受的盐的优选实例包括但不限于a与阳离子例如钠、钾、铵、镁、钙、多胺例如精胺和亚精胺形成的盐;b与无机酸例如盐酸、氢溴酸、硫酸、磷酸、硝酸形成的酸加成盐;c与有机酸例如乙酸、草酸、酒石酸、琥珀酸、马来酸、富马酸、葡糖酸、柠檬酸、苹果酸、抗坏血酸、苯甲酸、单宁酸、棕榈酸、海藻酸、聚谷氨酸、萘磺酸、甲磺酸、对甲苯磺酸、萘二磺酸、聚半乳糖醛酸形成的盐;和d由元素阴离子例如氯、溴和碘形成的盐。本发明的药物组合物可以多种方式给药,这取决于需要局部还是全身治疗并取决于待治疗的区域。给药可以是局部给药包括眼部和向黏膜,包括直肠递送,肺部给药例如通过吸入粉剂或气雾剂包括通过雾化器、气管内、鼻内、表皮和经皮、经口给药或胃肠外给药。胃肠外给药包括静脉内、动脉内、皮下、腹膜内或肌内注射或输注;或颅内例如鞘内给药、或心室内给药。认为具有至少一个2'-O-甲氧基乙基修饰的多核苷酸特别适用于经口给药。可以方便地以单位剂型提供的本公开的药物制剂可以根据制药工业中熟知的常规技术制备。这些技术包括使活性成分与药物载剂或赋形剂结合的步骤。通常,制剂通过以下步骤制备:使活性成分与液体载剂或细碎的固体载剂或两者均匀地结合,然后,如果需要,使产品成形。本公开还考虑了与其他治疗剂的组合疗法。可以与本公开的组合物同时递送的治疗剂的实例包括但不限于糖皮质激素类固醇例如但不限于泼尼松和地夫可特、血管紧张素转化酶抑制剂、β肾上腺素受体阻断剂、抗纤维化剂及其组合。在一些实施方案中,本发明可用于基因治疗,例如,使用包含本发明多核苷酸的载体例如表达载体指导多核苷酸在合适的宿主细胞中的表达。这些载体用于例如在宿主细胞中扩增多核苷酸以产生其有益量,并用于使用重组技术表达蛋白质。在一些实施方案中,载体是表达载体,其中本发明的多核苷酸与包含表达控制序列的多核苷酸可操作地连接。因此,本发明的另一方面提供一种治疗患者癌症的方法,该方法包括施用根据本发明第一方面的反义寡核苷酸、或施用药学有效量的包含反义寡核苷酸的组合物。载剂选自纳米颗粒,例如聚合物纳米颗粒;脂质体,例如pH敏感性脂质体、抗体缀合脂质体;病毒载体,阳离子脂质,聚合物,UsnRNA例如U7snRNA以及细胞穿透肽。反义寡核苷酸或组合物可以经口、或经直肠、或经黏膜、或经肠、或肌内、或皮下、或髓内、或鞘内、或直接心室内、或静脉内、或玻璃体内、或腹膜内、或鼻内、或眼内进行给药。即便如此,经证实的全身给药方案还包括静脉内、腹膜内、鼻内和鞘内。ASO与递送载剂例如纳米颗粒、基于聚合物或脂质体的载剂的复合可以进一步增强ASO向特定组织的递送效率。癌症是选自以下的任何一种:血液系统恶性肿瘤、肺癌、乳腺癌、前列腺癌、胃癌、睾丸癌、喉癌、肝癌、子宫癌、结肠直肠癌、黑色素瘤、胶质母细胞瘤、肉瘤和视网膜母细胞瘤。在本发明的另一个方面,提供了一种用于帮助对癌症患者进行分类或确定预后、或帮助癌症患者选择治疗策略的方法,该方法包括评估样品中PRDM15核酸、蛋白质或活性的水平。该方法包括利用关于样品中PRDM15核酸、蛋白质或活性水平的信息选择治疗方案的步骤。在各种实施方案中,从患者获得样品,并且该样品是怀疑患有癌症或已经发现患有癌症的组织样品或者包含来自所述组织的细胞。如果样品中PRDM15核酸、蛋白质或活性的水平升高,则所选择的治疗方案包括用PRDM15活性抑制剂或PRDM15的前体mRNA表达水平、mRNA表达水平和蛋白质表达水平的调节剂治疗患者。在各种实施方案中,抑制剂或调节剂包括根据本发明第一方面的反义寡核苷酸。在本发明的另一方面,提供了一种诱导PRDM15前体mRNA的外显子跳读的方法,该方法包括向细胞递送根据本发明第一方面的反义多核苷酸,或向细胞递送包含该反义寡核苷酸的药物组合物,从而诱导PRDM15前体mRNA的外显子跳读。优选地,外显子12和或外显子15被跳读。在各种实施方案中,细胞是人细胞。人细胞是癌细胞,癌症是选自以下的任何一种:血液系统恶性肿瘤、肺癌、乳腺癌、前列腺癌、胃癌、睾丸癌、喉癌、肝癌、子宫癌、结肠直肠癌、黑色素瘤、胶质母细胞瘤、肉瘤和视网膜母细胞瘤。在本发明的另一个方面,提供了一种试剂盒,其包括任选地在容器中的根据本发明第一方面的反义寡核苷酸、以及包装插页、包装标签、说明书或其他标签。本领域普通技术人员将理解,上述方法的应用广泛应用于识别适用于治疗许多其他疾病的反义分子。有利地,本发明提供了肿瘤学中的新靶标PRDM15。没有报道表明靶向PRDM15可能有益于抗肿瘤治疗。特别地,本发明使用反义寡核苷酸诱导PRDM15表达中的外显子跳读。使用ASO诱导PRDM15外显子15跳读并随后降低PRDM15蛋白水平是新颖的。本发明可用于开发针对多种癌症的PRDM15的一组高效IC50<25nM候选药物的新型化学制剂。为了使本发明可以被完全理解并且易于实施,现在将通过非限制性实施例仅描述本发明的优选实施方案,该描述参考所附说明性附图。在附图中:图1:人PRDM15基因组基因座的示意图。指出了每个ASO的位置。序列如下:ASO#274:UUGGAGGUGUCGAAGCACACGGGGUG[mU]*[mU]*[mG]*[mG]*[mA]*[mG]*[mG]*[mU]*[mG]*[mU]*[mC]*[mG]*[mA]*[mA]*[mG]*[mC]*[mA]*[mC]*[mA]*[mC]*[mG]*[mG]*[mG]*[mG]*[mU]*[mG]*ASO#275:UCAUCCAGUUGCAGUCAUCCUCGUU[mU]*[mC]*[mA]*[mU]*[mC]*[mC]*[mA]*[mG]*[mU]*[mU]*[mG]*[mC]*[mA]*[mG]*[mU]*[mC]*[mA]*[mU]*[mC]*[mC]*[mU]*[mC]*[mG]*[mU]*[mU]*ASO#276:ACUCACAGGCUCAUCCGGAGGGAC[mA]*[mC]*[mU]*[mC]*[mA]*[mC]*[mA]*[mG]*[mG]*[mC]*[mU]*[mC]*[mA]*[mU]*[mC]*[mC]*[mG]*[mG]*[mA]*[mG]*[mG]*[mG]*[mA]*[mC]*ASO#277:GGACCUCGGUAAUGAUCUCUGCCACUUGC[mG]*[mG]*[mA]*[mC]*[mC]*[mU]*[mC]*[mG]*[mG]*[mU]*[mA]*[mA]*[mU]*[mG]*[mA]*[mU]*[mC]*[mU]*[mC]*[mU]*[mG]*[mC]*[mC]*[mA]*[mC]*[mU]*[mU]*[mG]*[mC]**=硫代磷酸酯连接[mA]、[mU]、[mG]、[mC]=2’O-甲基RNA图2:PRDM15对于成年小鼠的组织稳态是非必要的。A.蛋白质印迹显示在各种成年小鼠组织中存在PRDM15蛋白。B.Prdm15‘首次敲除’条件等位基因的示意图改编自:http:www.mousephenotype.orgabout-ikmceucomm-programeucomm-targeting-strategiesC.Rosa26CreERT2CreER小鼠或PRDM15FFRosa26CreERT2PRDM15FFCreER小鼠的存活曲线,其在8周龄时注射他莫昔芬以产生PRDM15ΔΔ小鼠。D.4个月大的CreER和PRDM15ΔΔCreER小鼠的重量,其在8周龄时注射他莫昔芬。E.上图琼脂糖凝胶电泳显示Prdm15的野生型或在两侧敲入loxP的floxed等位基因,下图蛋白质印迹显示在D中所述的小鼠的各种器官中PRDM15和肌动蛋白的表达。F.C中所述的小鼠的骨髓细胞构成和器官重量。G.C中所述的小鼠的各种器官的苏木精和伊红染色H和E图像。图3:PRDM15对于EmuMyc小鼠模型中的淋巴瘤引发是必需的。A.蛋白质印迹显示出PRDM15在来自野生型或Eμ-Myc小鼠的骨髓来源的B细胞中的表达。B.在5周龄时注射他莫昔芬的CreEREμ-Myc小鼠或PRDM15FFCreEREμ-Myc小鼠的无病生存率。C.从PRDM15FFCreEREμ-Myc小鼠的骨髓中分离B细胞并在体外培养。加入4-OHT以诱导PRDM15缺失。蛋白质印迹验证了添加OHT后PRDM15蛋白的缺失。D.在PRDM15缺失后,通过CellTiterGlo细胞荧光ATP测定法所测量的活细胞数。E.用BrdU标记细胞,并通过FACS评估BrdU掺入。F.通过FACS基于BrdU掺入和PI染色确定细胞周期分析。G.通过FACS测定细胞凋亡。H.通过胱天蛋白酶Glo测定法测量胱天蛋白酶37活性。图4:PRDM15对EμMyc小鼠模型中的淋巴瘤维持是必需的。A移植了PRDM15FFCreEREμ-Myc淋巴瘤细胞并在1周后注射EtOH或他莫昔芬的小鼠的总无肿瘤生存率。移植了PRDM15FFCreEREμ-Myc淋巴瘤细胞并在1周后注射EtOH或他莫昔芬的小鼠的脾B和淋巴结C的重量。当对照EtOH小鼠开始显示出疾病迹象时,处死小鼠。上述小鼠的脾、淋巴结和骨髓中B220+细胞D和BrdU+细胞E的百分比。F此处描述了小鼠的脾切片的针对Ki67的苏木精伊红染色和免疫组织化学。图5:PRDM15靶标的全基因组鉴定。A.野生型B细胞、前体肿瘤Eμ-MycB细胞和Eμ-Myc肿瘤中PRDM15结合位点的重叠。B.在三种不同细胞类型中PRMD15体内结合的基序。图6:A.用于在体外诱导PRDM15前体mRNA的外显子跳读的反义寡核苷酸ASO设计。A-B.滴定PRDM15ASO。用不同的ASO以100nM的固定浓度转染细胞。收集RNA并通过以下方法测量外显子跳读的功效:A.半定量PCR并在凝胶上运行产物。分别设计针对外显子11至13上图,验证ASO#274和ASO#275和14至16中图,验证ASO#276和ASO#277的正向引物和反向引物,以便扩增较长同种型正常和缺少外显子12ASO#274和ASO#275和外显子15ASO#276和ASO#277的较短同种型由PRDM15-ASO诱导的外显子跳读产生。B.通过蛋白质印迹验证PRDM15蛋白质水平的降低。PRMT5是一种不相关的染色质修饰因子,用作特异性的对照和上样对照与肌动蛋白一起。C-E.PRDM15ASO处理后的体内表型效应。C.通过台盼蓝定量活细胞和死细胞;在用相应的ASO电穿孔后3天,DLBCL患者衍生的细胞中的D.相对活力和E.相对胱天蛋白酶37活性。图7:A.用于在体外诱导PRDM15前体mRNA的外显子跳读的反义寡核苷酸ASO设计。A-B.滴定PRDM15ASO。用指定量的ASO转染细胞。收集RNA并通过以下方法测量外显子跳读的功效:A.半定量PCR并在凝胶上运行产物。分别针对外显子14和外显子16设计正向引物和反向引物,以扩增含有外显子14、外显子15和外显子16的较长同种型正常,以及缺少外显子15的较短同种型由PRDM15-ASO诱导的外显子跳读产生。B.通过实时定量PCR测量的PRDM15外显子15相对于TBP的相对丰度。C.用指定的ASO转染人淋巴瘤细胞系Scr=干扰Scramble对照;P15=PRDM15ASO。收集RNA并通过半定量PCR测量外显子跳读的功效。分别针对外显子14和外显子16设计正向引物和反向引物,以扩增含有外显子14、外显子15和外显子16的较长同种型顶部条带,以及缺少外显子15的较短同种型由PRDM15-ASO诱导的外显子跳读产生。肌动蛋白用作上样对照底部条带。对活力和胱天蛋白酶37活化细胞凋亡进行定量。C-E.PRDM15ASO在体外淋巴瘤治疗中的治疗功效。C.从患者获得原发弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞,并用干扰对照或PRDM15-ASO电穿孔。通过半定量PCR验证ASO功效。D.通过蛋白质印迹验证PRDM15蛋白质水平的降低。Prmt5是一种不相关的染色质修饰因子,用作特异性的对照和上样对照与肌动蛋白一起。E-F.用相应的ASO电穿孔后3天,DLBCL患者衍生的细胞中的相对活力和相对半胱天冬酶37活性。图8:用于在体内诱导PRDM15前体mRNA的外显子跳读的反义寡核苷酸ASO设计。A.建立了DLBCLBCL13的PDX模型的队列。当肿瘤达到150mm3至250mm3的平均体积时,每2天通过瘤内注射PRDM15ASO或干扰对照进行治疗。在第21天评估肿瘤大小。数据代表不同生物重复的平均值±标准误。B.通过组织学分析评估肿瘤的坏死部分并定量右图。图9A:用于PRDM15的TMA染色的实例。左栏:表达高水平核PRDM15DLBCL、肺癌和结肠癌的肿瘤类型。右栏:表达低水平或无PRDM15肝细胞癌HCC、子宫内膜癌和肾癌的肿瘤类型。A-D用指定的ASOScr=干扰对照;P15=PRDM15ASO转染人结肠HCT116、乳腺MDA453、肺A357和前列腺PC3细胞系。对照正常前列腺上皮细胞系PrEC用于证明PRDM15以较低的蛋白质水平表达并且对于细胞存活是非必要的。B.收集RNA并通过半定量PCR测量外显子跳读的功效。分别针对外显子14和外显子16设计正向引物和反向引物,以扩增含有外显子14、外显子15和外显子16的较长同种型顶部条带,以及缺少外显子15的较短同种型由PRDM15-ASO诱导的外显子跳读产生。肌动蛋白用作上样对照。C.PRDM15、肌动蛋白和PRMT5的蛋白质印迹。D.用celltiterglo试剂盒定量得到的相对活力。PRDM15是一种非常有前景的抗癌治疗靶点。我们已经将PRDM15确定为胚胎发育过程中重要的蛋白质,但其对于正常的成体组织稳态是非必要的。PRDM15受到致癌基因MYC的直接转录控制,我们发现它在多种鼠和人类癌症中异常过表达。PRDM15属于推定的甲基转移酶家族,因此它可能被小分子抑制剂靶向。然而,迄今为止我们还没有确定相关的底物。因此,我们推断直接靶向PRDM15前体mRNA将是降低PRDM15蛋白质水平并选择性影响肿瘤生长的理想策略。我们的策略不仅更容易在药理学上实现因此更快地引入临床,而且可能另外具有更广泛和更稳健的抗肿瘤效果,因为这将抑制PRDM15的催化依赖性和独立性支架功能。无义介导的衰变NMD途径消除具有提前终止密码子的mRNA。我们推断,可以利用这种细胞机制诱导PRDM15前体mRNA的异常剪接,从而使其靶向NMD。我们建议使用剪接转换、NMD靶向、ASO作为PRDM15靶向的治疗方法。我们提供的证据表明,这种临床上兼容的策略具有稳健的抗肿瘤效果并适用于广泛的人类肿瘤即表达PRDM15的癌症。本发明的一个目的是提供用于治疗癌症的PRDM15的直接和选择性抑制剂。直接是指直接靶向PRDM15即影响PRDM15蛋白质丰度。选择性是指抑制剂特异性地抑制PRDM15,并且不抑制任何其他PRDM家族成员。考虑到几种PRDM家族成员在多种癌症中具有肿瘤抑制活性,这对于防止有害副作用即由治疗引起的医源性效应是重要的。这相当于提供了在有需要的对象中治疗癌症的方法,该方法包括向所述对象施用PRDM15的直接和选择性抑制剂的步骤。根据具体的实施方案,癌症具有高PRDM15蛋白质水平即,过表达PRDM15的癌症。值得注意的是,PRDM15在成体组织中要么不表达,要么以非常低的水平表达。因此,癌细胞中的过表达可以简单地是PRDM15蛋白的可检测到的表达。根据具体的实施方案,PRDM15的过表达意指PRDM15蛋白易于通过免疫组织化学IHC和或蛋白质印迹检测。根据具体的实施方案,癌症选自血液系统恶性肿瘤淋巴瘤和白血病、肺癌、乳腺癌、前列腺癌、胃癌、睾丸癌、喉癌、肝癌、子宫癌、结肠直肠癌、黑色素瘤、胶质母细胞瘤、骨肉瘤和视网膜母细胞瘤。根据更具体的实施方案,癌症是B细胞淋巴瘤滤泡性淋巴瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤。尽管PRDM15的任何直接和选择性抑制剂可适用于本文教导的方法,但特别设想PRDM15抑制剂在RNA水平起作用。更具体地,抑制剂是反义寡核苷酸ASO。反义寡核苷酸应该例如通过诱导PRDM15RNA降解而影响PRDM15的表达。甚至更特别设想的是诱导外显子跳读的反义寡核苷酸。最特别地,被跳读的外显子是外显子12或外显子15。因此,本文还提供了PRDM15反义寡核苷酸,其在PRDM15转录物中诱导外显子跳读。特别地,PRDM15反义寡核苷酸诱导外显子12或外显子15的跳读图1。还提供了这些反义寡核苷酸作为药物的用途。特别地,提供它们以用于治疗癌症例如血液系统恶性肿瘤淋巴瘤和白血病、肺癌、乳腺癌、前列腺癌、胃癌、睾丸癌、喉癌、肝癌、子宫癌、结肠直肠癌、黑色素瘤、胶质母细胞瘤、骨肉瘤和视网膜母细胞瘤。PRDM15抑制剂可以作为单一药剂施用,或与其他药剂例如化学治疗剂同时施用。定义将参照特定实施方案并参考一些附图来描述本发明,但是本发明不限于此,而仅由权利要求限制。权利要求中的任何附图标记不应被解释为限制其范围。所描述的附图仅是示意性的而非限制性的。在附图中,出于说明的目的可能放大一些元件的尺寸并且未按比例绘制。当在本说明书和权利要求书中使用术语“包括”时,不排除其他元素或步骤。当提及名词而不使用数量词时,其包括该名词的复数形式,除非另有特别说明。此外,说明书和权利要求书中的术语第一、第二、第三等用于区分相似元素,而不一定用于描述顺序或时间顺序。应理解为如此使用的术语在适当的情况下是可互换的,并且本文描述的本发明的实施方案能够以不同于本文所述或所说明的其他顺序操作。提供以下术语或定义仅用于帮助理解本发明。除非本文中明确定义,否则本文使用的所有术语具有与本发明领域技术人员所理解的相同的含义。从业者特别受Sambrook等人,MolecularCloning:ALaboratoryManual,第二版,ColdSpringHarbor出版社,Plainsview,NewYork1989;和Ausubel等人,CurrentProtocolsinMolecularBiology增刊47,JohnWiley和Sons,NewYork1999中关于本领域的定义和术语的指导。本文提供的定义不应被解释为具有小于本领域普通技术人员所理解的范围。如本文所用,“PRDM15”是指PRDM15基因人类中的基因ID:63977;小鼠中的基因ID:114604,也称为C21orf83、PFM15、ZNF298或由其编码的蛋白质。该基因编码在N末端含有PR结构域的Zn指核蛋白。实施例1PRDM15对于成年小鼠体内稳态是非必要的我们分析了PRDM15在成年小鼠组织中的表达,并且发现其广泛表达于各种主要器官脾、骨髓、肝、肾中图2A。为了研究Prdm15在体内生理和病理条件中的作用,我们产生了首次敲除小鼠模型25来自EUCOMM联盟欧洲条件小鼠诱变程序的原始构建体图2B。Prdm15lacZ等位基因的内含子3中剪接受体lacZ组件的存在阻止了功能性PRDM15蛋白的产生。为了产生Prdm15条件等位基因,我们将表达Prdm15lacZ+和翻转酶FLPe的小鼠杂交以切除lacZ组件。得到的Prdm15条件等位基因含有位于外显子4旁侧的loxP位点命名为Prdm15F图2B。使用PRMD15的他莫昔芬可诱导的敲除模型PRDM15FFRosa26Cre-ERT2,随后称为PRDM15FFCreER或简称FF,我们全身系统性删除了PRDM15称为PRDM15ΔΔCreER或简称ΔΔ。鉴于文献中考虑到关于非特异性Cre介导的毒性,我们使用没有在两侧敲入loxP的等位基因的Rosa26Cre-ERT2随后称为CreER小鼠作为对照。两组均在其8周龄时用他莫昔芬腹膜内注射IP以激活Cre重组酶,从而产生对照PRDM15野生型CreER或PRDM15空白PRDM15ΔΔCreER小鼠。我们现在已经观察了所得的PRDM15ΔΔ小鼠超过18个月,并且没有观察到任何不利的表型图2C。在他莫昔芬给药后2个月,CreER和PRDM15ΔΔ;CreER小鼠具有相似的重量图2D。我们使用被设计用于区分来自基因组DNA野生型和在两侧敲入loxP的等位基因的PCR引物验证了体内PRDM15缺失确实是有效的图2E上图,并且通过蛋白质印迹评估PRDM15蛋白质水平图2E下图。小鼠具有相似的器官大小、骨髓细胞构成和红细胞计数图2F。此外,组织学分析未显示出来自小鼠的各种组织之间的任何明显差异图2G。这些数据表明,在成年小鼠中,PRDM15对于正常组织稳态是非必要的,这与其在早期胚胎发育期间的必需功能形成鲜明对比Guccione和Mzoughi未发表。实施例2PRMD15是Myc驱动的淋巴瘤中的新型致癌基因我们观察到与野生型小鼠相比,PRDM15在从Eμ-Myc小鼠获得的骨髓B细胞中过表达,这表明PRDM15具有潜在的致癌功能图3A。因此,我们将CreER对照小鼠和PRDM15FFCreER小鼠在Eμ-Myc背景上杂交以获得CreEREμ-Myc小鼠和PRDM15FFCreEREμ-Myc小鼠。这些转基因小鼠发展成由MYC驱动的B细胞淋巴瘤,并且模型的条件使我们能够在肿瘤发展的各个阶段暂时使PRDM15缺失。PRDM15是肿瘤起始所必需的为了评估PRDM15在肿瘤起始中的作用,向具有前体肿瘤5周龄CreEREμ-Myc小鼠和PRDM15FFCreEREμ-Myc小鼠注射他莫昔芬并监测无病生存率。我们发现疾病发作有明显的延迟,其中PRDM15ΔΔCreEREμ-Myc小鼠的中位无病生存期为354天,而对照CreEREμ-Myc小鼠则为109天图3B。接下来,我们从PRDM15FFCreEREμ-Myc小鼠中分离出原代B细胞以研究PRDM15体外严重缺失的影响,以及确定图3B中观察到的淋巴瘤形成的延迟是否是PRDM15的细胞自主功能。在体外,通过在细胞培养基中加入4-OHT可以有效地实现PRDM15缺失,如通过蛋白质印迹所显示的不存在可检测的PRDM15蛋白图3C。严重PRDM15缺失导致活细胞数量减少图3D,这与DNA合成增殖减少BrdU阳性细胞数量减少图3E、以及G1和G2M中细胞数量的增加图3F有关。此外,PRDM15缺失引起胱天蛋白酶依赖性的细胞凋亡的显著增加图3G,同时观察到胱天蛋白酶9和胱天蛋白酶37的活性增加图3H。PRDM15是肿瘤维持所必需的为了评估PRDM15在肿瘤维持中的作用,从携带肿瘤的PRDM15FFCreEREμ-Myc小鼠中分离出原发性肿瘤并移植到同基因的受体小鼠中。在移植后第7天,给受体小鼠注射EtOH载剂对照或他莫昔芬,以使PRDM15缺失。如图4A所示,所有对照小鼠在第12天都具有可察觉的肿瘤,而TAM处理的小鼠中都不具有任何可察觉的肿瘤。在这个阶段第12天,我们从两组中处死了6只小鼠所有对照均生病。含有缺失PRDM15的肿瘤的小鼠具有显著低于对照组的疾病负荷,如通过它们的脾图4B和淋巴结图4C重量所确定的。通过FACS分析,我们证实注射他莫昔芬的小鼠的骨髓、脾和淋巴结具有比对照小鼠更低百分比的B细胞B220+图4D。另外,在处死之前,向小鼠脉冲注射BrdU,我们发现注射他莫昔芬的小鼠的骨髓、脾和淋巴结中的细胞的增殖能力明显低于对照小鼠图4E。示出了对照小鼠和注射他莫昔芬的小鼠的脾的代表性组织学图片图4F。实施例3PRDM15靶标的全基因组鉴定:PRDM15在其羧基末端含有多个锌指DNA结合结构域。我们通过对来自Myc驱动的肿瘤发展的不同阶段的B细胞进行芯片测序分析,来测试初步运行以测试可行性PRDM15是否会直接与DNA结合。PRDM15与正常B细胞以及前体肿瘤的和肿瘤的Eμ-Myc细胞中的约1000个位点结合图5A。从头基序分析鉴定了PRDM15的明确共有结合位点图5B,其与在小鼠胚胎干细胞Mzoughi和Guccione,未发表中所鉴定的非常相似。实施例4在体外和体内用反义寡核苷酸靶向人淋巴瘤中的PRDM15。我们先前已经证明了反义寡核苷酸ASO通过影响其前体mRNA的稳定性而作为有效且特异性地降低靶蛋白表达的手段的潜在用途。具体而言,我们设计ASO以诱导前体mRNA转录物例如Mdm4、Ep400、Dvl1的外显子跳读或内含子保留,这会产生提前终止密码子或移码,从而导致无义介导的延迟和随后的蛋白质水平降低26,27。重要的是,我们已经证明了我们的方法在黑色素瘤和DLBCL的PDX模型中的功效26,并且新一代ASO在静脉内给药后在滤泡性淋巴瘤和DLBC淋巴瘤的临床前模型和临床模型中作为单一药剂是有效的28。在这里,反义寡核苷酸被设计成分别诱导PRDM15外显子15ASO#276和ASO#277或PRDM15外显子12ASO#274和ASO#275的跳读图6。我们还对ASO#276进行了测试,以评估其IC50=25nM图6A至图6B。接下来我们评估了在4种DLBCL细胞系图6C以及在原发性、三重变化、患者衍生的弥漫性大B细胞淋巴瘤具有MYC+、以及BCL2和BCL6的易位的THDLBCL中的功效。PRDM15ASO有效地导致外显子15的跳读图6D,并因此使PRDM15蛋白质水平降低图6E。重要的是,这是高度特异性的,并且不影响管家蛋白、肌动蛋白或另一种测试蛋白PRMT5的水平图6E。在这些原发性DLBCL细胞中,通过反义寡核苷酸介导的外显子跳读而使PRDM15蛋白缺失显著地降低了细胞活力图6F。这伴随着胱天蛋白酶37活性的显著增加,从而表明了细胞凋亡图6G。与对照相比范围是0%至6%的坏死,当在5个独立动物中进行瘤内注射时,在所有测试的THDLBCLPDX中相同的PRDM15ASO诱导肿瘤尺寸减小,并且最重要的是强烈诱导坏死范围是11%至50%的侵润组织图8A至图8B。最后,我们将PRDM15的几种肿瘤组织样品染色[通过IHC,免疫组织化学]图9A。肺癌和结肠癌表达非常高水平的核PRDM15,而PRMD15的水平在肝癌、子宫内膜癌和肾癌中较低。为了评估PRDM15在这些肿瘤类型中维持癌症生长的相关性,我们测试了PRDM15-ASO处理对代表性细胞系的影响。我们在所有测试的细胞系中诱导了有效的外显子跳读图9B。值得注意的是,我们观察到所有测试的癌症细胞系[人结肠癌HCT116、乳腺癌MDA453、肺癌A357和前列腺癌PC3细胞系]的蛋白质水平图9C和活力图9D的降低,但正常的前列腺上皮细胞系PrEC的蛋白质水平和活力没有降低图9D右栏。方法ASO#274:UUGGAGGUGUCGAAGCACACGGGGUG[mU]*[mU]*[mG]*[mG]*[mA]*[mG]*[mG]*[mU]*[mG]*[mU]*[mC]*[mG]*[mA]*[mA]*[mG]*[mC]*[mA]*[mC]*[mA]*[mC]*[mG]*[mG]*[mG]*[mG]*[mU]*[mG]*ASO#275:UCAUCCAGUUGCAGUCAUCCUCGUU[mU]*[mC]*[mA]*[mU]*[mC]*[mC]*[mA]*[mG]*[mU]*[mU]*[mG]*[mC]*[mA]*[mG]*[mU]*[mC]*[mA]*[mU]*[mC]*[mC]*[mU]*[mC]*[mG]*[mU]*[mU]*ASO#276:ACUCACAGGCUCAUCCGGAGGGAC[mA]*[mC]*[mU]*[mC]*[mA]*[mC]*[mA]*[mG]*[mG]*[mC]*[mU]*[mC]*[mA]*[mU]*[mC]*[mC]*[mG]*[mG]*[mA]*[mG]*[mG]*[mG]*[mA]*[mC]*ASO#277:GGACCUCGGUAAUGAUCUCUGCCACUUGC[mG]*[mG]*[mA]*[mc]*[mC]*[mU]*[mC]*[mG]*[mG]*[mU]*[mA]*[mA]*[mU]*[mG]*[mA]*[mU]*[mC]*[mU]*[mC]*[mU]*[mG]*[mC]*[mC]*[mA]*[mCl*[mU]*[mU]*[mG]*[mC]**=硫代磷酸酯连接[mA]、[mU]、[mG]、[mC]=2’O-甲基RNADLBCLPDX所有程序均按照机构评审委员会SGH的指导性道德原则批准和执行。获得了仅用于特定研究目的使用这些样品的知情同意书。用于构建DLBCL异种移植物的肿瘤样品来自一名53岁男性,其具有10年前患I期弥漫性大B细胞淋巴瘤的既往病史,并且用CHOP环磷酰胺、阿霉素、长春新碱、泼尼松龙化学疗法治疗得到完全缓解。他向我院提出了在骨髓、软脑膜和胸腔积液中疾病复发。他接受了2个疗程的RICE利妥昔单抗、异环磷酰胺、卡铂、依托泊苷和鞘内注射氨甲蝶呤阿糖胞苷,然后接受了4个疗程的DHAP地塞米松、阿糖胞苷、顺铂和鞘内注射氨甲蝶呤,但疾病继续发展,患者一年后死于疾病复发。胸膜流体的细胞学检查显示具有松散的淋巴瘤群体特征的大细胞且具有囊泡状染色质和明显核仁。肿瘤细胞表达泛B标志物PAX5、CD20、CD22、CD79a,同时伴随CD5异常表达、bcl2强表达、和70%至80%高增殖分数。肿瘤性淋巴细胞显示非生发中心表型CD10-、bcl6+、MUM1+、FOXP1+,但c-myc染色低至20%。间期荧光原位杂交显示出BCL2的增加以及BCL6和IGH基因的重排,然而观察到了C-MYC的正常模式。异种移植物的构建和处理:将胸膜流体收集至冷的无菌20%RPMI1640培养基中。用Ficoll-PaquePLUSGEHealthcare,OH分离胸膜流体中的肿瘤细胞,随后重悬于含有20%胎牛血清LifeTechnologies,CA的RPMI160培养基LifeTechnologies,CA中。将肿瘤样品的代表性部分固定在10%的中性缓冲福尔马林中,另一部分用于异种移植。然后将细胞悬浮液皮下植入4至6周龄NODscid小鼠。定期监测肿瘤并使其建立并生长至最大的1000mm3。然后处死小鼠,收获肿瘤并进行常规尸检。异种移植肿瘤立即新鲜冷冻,经福尔马林固定,储存在90%FBS和10%DMSO中或置于RPMI160培养基中。重复该过程以产生后代的PDX模型P2、P3、P4……。为了评估形态的维持和原始肿瘤的主要特征,将来自患者肿瘤样品的经福尔马林固定、石蜡包埋FFPE的组织切片和所有已建立的患者衍生的异种移植模型的异种移植物用苏木精和伊红H和E染色。此外,还对这些切片进行免疫染色以确定各种标志物的表达。所有这些载玻片均由临床病理学家单独观察和评价。对于目前的研究,将肿瘤碎片约50mg,P4皮下植入雌性NODscid4周至6周小鼠的侧腹。使肿瘤生长至约150mm3至250mm3。将动物随机分成两个不同的组n=5,如下所述:组-I-干扰的Vivo-MorpholinosGeneToolsInc剂量25μL,肿瘤内,组-II-靶向外显子6的Vivo-MorpholinosGeneToolsInc剂量25μL,肿瘤内。定期监测动物并在处理期间每天测量体重。在处理期结束时,处死所有动物,取出肿瘤,称重并观察总体病理学。然后将每块分成两部分。将一块肿瘤在室温下在10%NBF中固定24小时,然后石蜡包埋。将另一块快速冷冻用于RNA和蛋白质分析。免疫组织化学对于免疫组织化学分析,切开肿瘤,在4%PFA中固定48小时,然后进行石蜡包埋ThermoScientificExcelsiorTMASTissueProcessor和HistoStarTMEmbeddingWorkstation。然后将样品切片为5μm,置于SuperfrostTMPlus黏附载玻片ThermoScientific上并针对KI671200,ThermoScientific#RM-9106-20S,克隆SP6,兔单克隆进行免疫染色并用胱天蛋白酶-3对其切割1300,CellSignallingTechnology,Asp175,兔多克隆,简述如下。用于免疫组织化学的载玻片在二甲苯中脱石蜡,然后在乙醇系列100%、95%、和70%和蒸馏水中再水化。将载玻片在室温下在3%H2O2中温育15分钟以实现内源性过氧化物酶的抑制。使用2100修复锅Retriever在柠檬酸盐缓冲液pH6中进行表位恢复。将切片在1%BSA溶液中在室温下封闭40分钟,然后在+4℃下与一抗一起温育过夜。对于在兔中产生的两种一抗,然后将EnVision+HRP试剂DakoK400311在室温下于切片上施用45分钟。最后通过二氨基联苯胺色原反应过氧化物酶底物试剂盒,DAB,SK-4100;Vector实验室揭示免疫反应性。接下来,将载玻片在苏木精Diapath#C0302中复染,在乙醇系列中脱水,在二甲苯中清洁,并用树脂封固剂MicromountDiapath,#60200永久固定。在步骤之间使用0.1%吐温20TBS溶液作为洗涤缓冲液。为了评估增殖和凋亡指数,应用在ImageJ软件平台上创建的数字图像分析算法,在从每个肿瘤切片的不同区域随机选择的三个显微镜视野中计数Ki67或切割的胱天蛋白酶-3阳性和阴性核。然后将增殖和凋亡指数表示为阳性核数和总核数之间的比。活力和细胞凋亡测定CellTiter-Glo试剂盒Promega或CellTiter96AQueous单溶液细胞增殖测定法Promega用作细胞活力测定。在透明平底96孔板Corning中将细胞用胰蛋白酶处理、计数并接种5000细胞孔。4872小时后,如制造商方案中所述,将细胞与CellTiter-Glo或CellTiter96Aqueous单溶液一起温育。1小时后,用TecanSafire2酶标仪读取发光吸光度。使用胱天蛋白酶-Glo37测定试剂盒Promega进行凋亡测定。在不透明平底96孔板Corning中将细胞用胰蛋白酶处理、计数并接种5000细胞孔。4872小时后,如制造商方案中所述,将细胞用胱天蛋白酶-Glo37测定法进行温育。体外转染ASO将ASO以50nM的终浓度进行转染。脂质体Lipofectamine2000Invitrogen用于PC3,…,HiPerfectQiagen用于PREC细胞,使用氖转染系统的电穿孔Invitrogen用于所有淋巴瘤细胞系。根据制造商的方案采用对于每种细胞系的优化条件使用所有试剂。RNA分离和cDNA合成根据制造商的方案,使用PurelinkRNA迷你试剂盒ThermoFisher分离RNA,用柱上DNA酶消化。使用Maxima第一链cDNA试剂盒ThermoFisher将RNA逆转录成cDNA。他莫昔芬注射用在矿物油中的1.5mg他莫昔芬Sigma向2月龄的CreER和PRDM15FFCreER小鼠或5周龄CreEREμ-Myc和PRDM15FFCreEREμ-Myc小鼠连续进行腹膜内注射3天。DNA分离和重组验证根据制造商的说明,用DNeasy血液和组织试剂盒Qiagen在体外从整个器官或细胞中分离DNA。使用以下引物:F-5’-AAGACATTGGGTGCACAG-3’和R-5’-GTGGCAGATGGCGCGGCAACACCATT-3’。PCR循环条件如下:初始保持温度95℃持续5分钟,37个循环的变性95℃持续45秒、退火57℃持续30秒和延伸72℃持续2分钟。最后,延伸温度为72℃,持续4分钟,并且保持温度为4℃。使用DreamTaqGreenPCRMasterMixThermoFisher,并在2%琼脂糖凝胶上通过凝胶电泳观察产物。对于重组等位基因,预期有500bp的条带。对于未重组的等位基因,预期有约1400bp的条带。通过半定量PCR验证ASO功效使用以下引物:PRDM15外显子11至13:F-5’-CAGTGCCCGAGAGCGAGAAT-3’和R:5’-TTGTGCTCCCCGAGCTGTTT-3’;PRDM15外显子14至16:F-5’-TTGAGTCCAGGAGGGTCGCC-3’和R:5’-CACTTTACACGCCCACTGGCT-3’。PCR循环条件如下:初始保持温度95℃持续5分钟,27个循环的变性95℃持续45秒、退火58℃持续30秒和延伸72℃持续1分钟。最后,延伸温度72℃持续4分钟,并且保持温度为4℃。使用DreamTaqGreenPCRMasterMixThermoFisher,并在2%琼脂糖凝胶上通过凝胶电泳观察产物。对于PRDM15外显子11至13,预期产物大小为371bp,对于具有外显子12跳读的PRDM15外显子11至13,预期产物大小为119bp。对于完整的PRDM15外显子14至16,预期产物大小为358bp,对于具有外显子15跳读的PRDM15外显子14至16,预期产物大小为229bp。对于PRDM15外显子15的实时定量PCR定量,使用以下引物:F:5’-CCTCCGGATGAGCCTGTGAGT-3’和R:5’-GGTGGCCAGCTTCCCCAGAAC-3’。根据制造商的方案使用ExpressSYBRGreenERqPCRSupermixThermoFisher。蛋白质印迹用Bio-RadRCDC蛋白质测定法对总蛋白质裂解物进行定量。在8%SDS-PAGE凝胶上分离等量的蛋白质,并转移到PVDF膜上。使用PonceauSSigmaP7170验证转移效率。将膜在PBST中的5%牛奶中封闭,并与针对PRDM151:500、肌动蛋白1:1000,SantaCruz47778或Prmt51:500,SantaCruz22132的一抗温育过夜。第二天,将膜在PBST中洗涤三次,与适当的HRP缀合的二抗1:10000,山羊PromegaV8051小鼠SantaCruz2005兔SantaCruz2030一起温育1小时并在PBST洗涤三次。用ThermoScientificSupersignalWestPico化学发光底物#34080和膜ThermoScientificCL-Xposurefilm#34089观察信号。尽管在前面的描述中已经描述了本发明的优选实施方案,但是本领域技术人员将理解,在不脱离本发明的情况下,可以对设计或构造的细节进行许多变化或修改。参考文献1Fumasoni,I.等人FamilyexpansionandgenerearrangementscontributedtothefunctionalspecializationofPRDMgenesinvertebrates.BMCevolutionarybiology7,187,doi:10.11861471-2148-7-1872007.2Ma,Z.,Swigut,T.,Valouev,A.,Rada-Iglesias,A.和Wysocka,J.Sequence-specificregulatorPrdm14safeguardsmouseESCsfromenteringextraembryonicendodermfates.NatStructMolBiol18,120至127,doi:10.1038nsmb.20002011.3Yamaji,M.等人PRDM14ensuresnaivepluripotencythroughdualregulationofsignallingandepigeneticpathwaysinmouseembryonicstemcells.Cellstemcell12,368-382,doi:10.1016j.stem.2012.12.0122013.4Huang,S.,Shao,G.和Liu,L.ThePRdomainoftheRb-bindingzincfingerproteinRIZ1isaproteinbindinginterfaceandisrelatedtotheSETdomainfunctioninginchromatinmediatedgeneexpression.JBiolChem273,15933-159391998.5Wu,H.等人StructuralbiologyofhumanH3K9methyltransferases.PLoSOne5,e8570,doi:10.1371journal.pone.00085702010.6Hayashi,K.,Yoshida,K.和Matsui,Y.AhistoneH3methyltransferasecontrolsepigeneticeventsrequiredformeioticprophase.Nature438,374-378,doi:DOI10.1038nature041122005.7Koh-Stenta,X.等人CharacterisationofthehistonemethyltransferasePRDM9utilisingbiochemical,biophysicalandchemicalbiologytechniques.TheBiochemicaljournal,doi:10.1042BJ201403742014.8Eram,M.S.等人TrimethylationofhistoneH3lysine36byhumanmethyltransferasePRDM9protein.TheJournalofbiologicalchemistry289,12177-12188,doi:10.1074jbc.M113.5231832014.9Derunes,C.等人CharacterizationofthePRdomainofRIZ1histonemethyltransferase.BiochemBiophResCo333,925至934,doi:10.1016j.bbrc.2005.05.1902005.10Pinheiro,I.等人Prdm3andPrdm16areH3K9me1methyltransferasesrequiredformammalianheterochromatinintegrity.Cell150,948至960,doi:10.1016j.cell.2012.06.0482012.11Eom,G.H.等人HistonemethyltransferasePRDM8regulatesmousetestissteroidogenesis.BiochemBiophResCo388,131至136,doi:10.1016j.bbrc.2009.07.1342009.12Huang,S.Theretinoblastomaprotein-interactingzincfingergeneRIZin1p36-linkedcancers.FrontBiosci4,D528至5321999.13Mock,B.A.,Liu,L.,LePaslier,D.和Huang,S.TheB-lymphocytematurationpromotingtranscriptionfactorBLIMP1PRDI-BF1mapstoD6S447onhumanchromosome6q21-q22.1andthesyntenicregionofmousechromosome10.Genomics37,24至281996.14Buyse,I.M.,Takahashi,E.和Huang,S.PhysicalmappingoftheretinoblastomainteractingzincfingergeneRIZtoD1S228onchromosome1p36.Genomics34,119至121,doi:DOI10.1006geno.1996.02491996.15Yang,X.H.和Huang,S.PFM1PRDM4,anewmemberofthePR-domainfamily,mapstoatumorsuppressorlocusonhumanchromosome12q23至q24.1.Genomics61,319至325,doi:DOI10.1006geno.1999.59671999.16Pasqualucci,L.等人InactivationofthePRDM1BLIMP1geneindiffuselargeBcelllymphoma.JExpMed203,311至317,doi:10.1084jem.200522042006.17Nie,K.等人MicroRNA-MediatedtranslationrepressionofPRDM1inHodgkinReedSternbergcells-ApotentialpathogeneticlesioninHodgkinlymphoma.Blood108,185a186a2006.18Nie,K.等人EpigeneticDown-RegulationoftheTumorSuppressorGenePRDM1Blimp1inDiffuseLargeBCellLymphomasAPotentialRoleoftheMicroRNALet-7.AmericanJournalofPathology177,1470至1479,doi:DOI10.2353ajpath.2010.0912912010.19Tam,W.等人MutationalanalysisofPRDM1indicatesatumor-suppressorroleindiffuselargeB-celllymphomas.Blood107,4090至4100,doi:DOI10.1182blood-2005-09-37782006.20Mandelbaum,J.等人BLIMP1isatumorsuppressorgenefrequentlydisruptedinactivatedBcell-likediffuselargeBcelllymphoma.CancerCell18,568至579,doi:10.1016j.ccr.2010.10.0302010.21Hussin,J.等人RareallelicformsofPRDM9associatedwithchildhoodleukemogenesis.Genomeresearch23,419至430,doi:10.1101gr.144188.1122013.22Woodward,E.L.,Olsson,M.L.,Johansson,B.和Paulsson,K.AllelicvariantsofPRDM9associatedwithhighhyperdiploidchildhoodacutelymphoblasticleukaemia.BrJHaematol166,947至949,doi:10.1111bjh.129142014.23Fog,C.K.等人LossofPRDM11promotesMYC-drivenlymphomagenesis.Blood125,1272至1281,doi:DOI10.1182blood-2014-03-5608052015.24Giallourakis,C.C.等人Genome-wideAnalysisofImmuneSystemGenesbyExpressedSequenceTagProfiling.JImmunol190,5578至5587,doi:DOI10.4049jimmunol.12034712013.25Skarnes,W.C.等人Aconditionalknockoutresourceforthegenome-widestudyofmousegenefunction.Nature474,337至342,doi:10.1038nature101632011.26Dewaele,M.等人Antisenseoligonucleotide-mediatedMDM4exon6skippingimpairstumorgrowth.JClinInvest,doi:10.1172JCI825342015.27Koh,C.M.等人MYCregulatesthecorepre-mRNAsplicingmachineryasanessentialstepinlymphomagenesis.Nature523,96至100,doi:10.1038nature143512015.28Hong,D.等人AZD9150,anext-generationantisenseoligonucleotideinhibitorofSTAT3withearlyevidenceofclinicalactivityinlymphomaandlungcancer.SciTranslMed7,314ra185,doi:10.1126scitranslmed.aac52722015.

权利要求:1.一种用于调节PRDM15活性的经分离的反义寡核苷酸。2.根据权利要求1所述的反义寡核苷酸,其中所述寡核苷酸调节前体mRNA、成熟mRNA和蛋白质表达的活性或水平中的一种或多于一种。3.根据权利要求2所述的反义寡核苷酸,其中所述寡核苷酸抑制PRDM15的表达或修饰其表达产物。4.根据权利要求3所述的反义寡核苷酸,其中所述寡核苷酸通过诱导PRDM15前体mRNA或成熟mRNA的外显子跳读来抑制PRDM15的表达,从而诱导细胞周期停滞或凋亡。5.根据前述权利要求中任一项所述的反义寡核苷酸,其中所述寡核苷酸与PRDM15前体mRNA或成熟mRNA的靶区域特异性杂交。6.根据权利要求5所述的反义寡核苷酸,其中所述靶区域是选自以下的任何外显子、内含子或外显子-内含子边界:外显子8、外显子9、外显子11、外显子12、外显子15、外显子16、外显子17、外显子18、外显子21、外显子24、外显子25、外显子29、内含子7、内含子8、内含子11、内含子12、内含子14和内含子15。7.根据前述权利要求中任一项所述的反义寡核苷酸,其中所述反义寡核苷酸包括选自SEQIDNO:1至SEQIDNO:73中任一个的序列。8.根据前述权利要求中任一项所述的反义寡核苷酸,其中所述反义寡核苷酸包括经修饰的多核苷酸主链。9.根据权利要求8所述的反义寡核苷酸,其中所述经修饰的多核苷酸主链包括至少一个多核苷酸的糖被取代的修饰部分。10.根据权利要求9所述的反义寡核苷酸,其中所述修饰部分选自磷酰二胺吗啉代寡聚物PMO、肽缀合的磷酰二胺吗啉代寡聚物PPMO和非肽树枝状聚合物八胍部分标记的吗啉代寡聚物。11.根据权利要求8至10中任一项所述的反义寡核苷酸,其中所述经修饰的多核苷酸主链包括至少一个经修饰的核苷酸间连接。12.根据权利要求11所述的反义寡核苷酸,其中所述经修饰的核苷酸间连接包括经修饰的磷酸酯。13.根据权利要求12所述的反义寡核苷酸,其中所述经修饰的磷酸酯是选自以下的任一种:非桥接氧原子被硫原子取代的磷酸酯、膦酸酯、硫代磷酸酯、磷酸二酯、吗啉磷酸酯、哌嗪磷酸酯和氨基磷酸酯。14.根据前述权利要求中任一项所述的反义寡核苷酸,其中所述反义寡核苷酸包括主链,所述主链选自核糖核酸、脱氧核糖核酸、DNA硫代磷酸酯、RNA硫代磷酸酯、2'-O-甲基-寡核糖核苷酸和2'-O-甲基-寡脱氧核糖核苷酸、2'-O-烃基核糖核酸、2'-O-烃基DNA、2'-O-烃基RNA硫代磷酸酯、2'-O-烃基DNA硫代磷酸酯、2'-F-硫代磷酸酯、2'-F-磷酸二酯、2'-甲氧基乙基硫代磷酸酯、2-甲氧基乙基磷酸二酯、脱氧亚甲基甲基亚氨基脱氧MMI、2'-O-烃基MMI、脱氧甲基膦酸酯、2'-O-烃基甲基膦酸酯、吗啉代、4'-硫代DNA、4'-硫代RNA、肽核酸、3'-酰胺化物、脱氧3'-酰胺化物、2'-O-烃基3'-酰胺化物、锁核酸、环己烷核酸、三环-DNA、2'-氟-阿拉伯核酸、N3'-P5'氨基磷酸酯、氨基甲酸酯连接的主链、磷酸三酯连接的主链、尼龙改性的主链和前述主链的混合物。15.根据前述权利要求中任一项所述的反义寡核苷酸,其中所述寡核苷酸与一种或多于一种缀合物化学连接,所述缀合物增强反义寡核苷酸的活性、细胞分布或细胞摄取。16.根据权利要求1至15中任一项所述的反义寡核苷酸,其用于治疗表达PRDM15的癌症患者。17.根据权利要求16所述的反义寡核苷酸,其中向所述患者施用另外的抗癌剂或治疗剂。18.根据权利要求16或17所述的反义寡核苷酸,其中所述癌症是选自以下的任一种:血液系统恶性肿瘤、肺癌、乳腺癌、前列腺癌、胃癌、睾丸癌、喉癌、肝癌、子宫癌、结肠直肠癌、黑色素瘤、胶质母细胞瘤、肉瘤和视网膜母细胞瘤。19.根据权利要求18所述的反义寡核苷酸,其中所述血液系统恶性肿瘤是淋巴瘤或白血病。20.根据权利要求19所述的反义寡核苷酸,其中所述淋巴瘤是B细胞淋巴瘤。21.根据权利要求20所述的反义寡核苷酸,其中所述B细胞淋巴瘤是滤泡性淋巴瘤或弥漫性大B细胞淋巴瘤。22.一种药物组合物,其包含根据权利要求1至15中任一项所述的反义寡核苷酸和药学上可接受的载剂。23.根据权利要求22所述的药物组合物,其中所述组合物适于单独地或与递送剂复合经胃肠外施用至患者。24.根据权利要求22或23中任一项所述的组合物,其中所述载剂选自纳米颗粒,例如聚合物纳米颗粒;脂质体,例如pH敏感性脂质体、抗体缀合脂质体;病毒载体,阳离子脂质,聚合物,UsnRNA例如U7snRNA,和细胞穿透肽。25.根据权利要求22至24中任一项所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸经口、或经直肠、或经黏膜、或经肠、或肌内、或皮下、或髓内、或鞘内、或直接心室内、或静脉内、或玻璃体内、或腹膜内、或鼻内、或眼内进行给药。26.一种治疗患者癌症的方法,所述方法包括施用根据权利要求1至15中任一项所述的反义寡核苷酸,或药学有效量的根据权利要求22至25中任一项所述的组合物。27.根据权利要求26所述的方法,其中载剂选自纳米颗粒,例如聚合物纳米颗粒;脂质体,例如pH敏感性脂质体、抗体缀合脂质体;病毒载体,阳离子脂质,聚合物,UsnRNA例如U7snRNA,和细胞穿透肽。28.根据权利要求26或27中任一项所述的方法,其中所述反义寡核苷酸或组合物经口、或经直肠、或经黏膜、或经肠、或肌内、或皮下、或髓内、或鞘内、或直接心室内、或静脉内、或玻璃体内、或腹膜内、或鼻内、或眼内进行给药。29.根据权利要求26至28中任一项所述的方法,其中所述癌症是选自以下的任一种:血液系统恶性肿瘤、肺癌、乳腺癌、前列腺癌、胃癌、睾丸癌、喉癌、肝癌、子宫癌、结肠直肠癌、黑色素瘤、胶质母细胞瘤、肉瘤和视网膜母细胞瘤。30.调节PRDM15活性的反义寡核苷酸在制备用于治疗癌症的药物中的用途。31.根据权利要求30所述的用途,其中所述寡核苷酸调节前体mRNA、成熟mRNA和蛋白质表达的活性或水平中的一种或多于一种。32.根据权利要求31所述的用途,其中所述寡核苷酸抑制PRDM15的表达或修饰其表达产物。33.根据权利要求30至32中任一项所述的用途,其中所述癌症是选自以下的任一种:血液系统恶性肿瘤、肺癌、乳腺癌、前列腺癌、胃癌、睾丸癌、喉癌、肝癌、子宫癌、结肠直肠癌、黑色素瘤、胶质母细胞瘤、肉瘤和视网膜母细胞瘤。34.一种用于帮助对癌症患者进行分类或确定预后、或者帮助癌症患者选择治疗策略的方法,所述方法包括评估样品中PRDM15核酸、蛋白质或活性的水平。35.根据权利要求34所述的方法,其还包括利用关于样品中PRDM15核酸、蛋白质或活性水平的信息来选择治疗方案的步骤。36.根据权利要求34或35所述的方法,其中从所述患者获得样品,并且所述样品是怀疑患有癌症或已经发现患有癌症的组织样品,或者包含来自所述组织的细胞。37.根据权利要求34至36中任一项所述的方法,其中如果样品中PRDM15核酸、蛋白质或活性的水平升高,则所选择的治疗方案包括用PRDM15活性抑制剂或PRDM15的前体mRNA表达水平、mRNA表达水平和蛋白质表达水平的调节剂来治疗患者。38.根据权利要求37所述的方法,其中所述抑制剂或调节剂包括根据权利要求1至15中任一项所述的反义寡核苷酸。39.一种诱导PRDM15前体mRNA的外显子跳读的方法,所述方法包括向细胞递送权利要求1至15中任一项所述的反义多核苷酸,或权利要求22至25中任一项所述的组合物,从而诱导PRDM15前体mRNA的外显子跳读。40.根据权利要求39所述的方法,其中外显子12和或外显子15被跳读。41.根据权利要求39或40中任一项所述的方法,其中所述细胞是人细胞。42.根据权利要求41所述的方法,其中所述人细胞是癌症细胞,所述癌症是选自以下的任一种:血液系统恶性肿瘤、肺癌、乳腺癌、前列腺癌、胃癌、睾丸癌、喉癌、肝癌、子宫癌、结肠直肠癌、黑色素瘤、胶质母细胞瘤、肉瘤和视网膜母细胞瘤。43.一种试剂盒,其包括任选地在容器中的权利要求1至21中任一项所述的反义寡核苷酸、和包装插页、包装标签、说明书或其他标签。

百度查询: 新加坡科技研究局 通过靶向PRDM15的反义寡核苷酸治疗癌症的方法

免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息,力求客观、公正,但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解,仅供参考使用,不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。