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申请/专利权人:嘉兴允英医学检验有限公司
摘要:本发明涉及一种TCF3‑PBX1融合基因检测探针的制备方法,通过优化探针以及独特的检测方法,可在4h~5h内完成杂交实验,节约了杂交实验所耗费的时间,降低了杂交背景和制备成本。采用本发明制备的TCF3‑PBX1融合基因检测探针用于TCF3‑PBX1融合基因检测时,具有很高的特异性和样本检出率。
主权项:1.一种TCF3-PBX1融合基因检测探针的制备方法,其特征在于,包括如下步骤:选择hg19参考基因组的chr19号染色体的1259000~2002000区域作为TCF3探针的目标片段;根据所述TCF3探针的目标片段设计TCF3探针;设计所述TCF3探针的要求包括:长度为49~51bp,相邻两个TCF3探针之间间隔为4~6bp,GC含量在30%~80%之间,连续重复碱基长度小于5bp;将所得的每条TCF探针的5’端加上如SEQIDNO.1所示的标签片段,将所得的每条TCF3探针的3’端加上如SEQIDNO.2所示的标签片段,制备带有标签的TCF3探针库;使用带有荧光基团A的引物对对所述带有标签的TCF3探针库进行扩增标记反应,制备荧光标记的TCF3探针库;和或,选择hg19参考基因组的chr1号染色体的64374000~165018000区域作为PBX1探针的目标片段;根据所述PBX1探针的目标片段设计PBX1探针;设计所述PBX1探针的要求包括:长度为49~51bp,相邻两个PBX1探针之间间隔为4~6bp,GC含量在30%~80%之间,连续重复碱基长度小于5bp;将所得的每条PBX1探针的5’端加上如SEQIDNO.5所示的标签片段,将所得的每条PBX1探针的3’端加上如SEQIDNO.6所示的标签片段,制备带有标签的PBX1探针库;用带有荧光基团A’的引物对所述带有标签的PBX1探针库进行扩增标记反应,制备荧光标记的PBX1探针库;所述荧光标记的TCF3探针库和所述荧光标记的PBX1探针库构成了TCF3-PBX1融合基因检测探针。
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