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申请/专利权人:厦门致善生物科技股份有限公司
摘要:本发明属于生物学领域,具体涉及一种定量检测多个NUP98融合基因的方法以及试剂盒。为解决NUP98融合基因检测的问题,本申请利用实时荧光PCR技术对多个NUP98融合基因进行同时检测,进一步提供了同时检测多个NUP98融合基因的试剂盒。本发明的方法以及试剂盒可单次上机同时对多样本进行定量检测,检测通量高、灵敏度高、且安全简便。
主权项:1.一种定量检测多个NUP98融合基因的方法,所述方法包括:a提供含有不同NUP98融合基因的靶核酸的样品,并且,针对每一种靶核酸,提供能够扩增所述靶核酸的引物组,所述引物组包含至少一条上游引物和至少一条下游引物,其中,所述上游引物能够靶向所述靶核酸中编码NUP98蛋白的核苷酸的序列;以及,针对每一种靶核酸,提供能够与所述靶核酸中NUP98融合基因的序列特异性杂交的检测探针,所述检测探针标记有报告基团和淬灭基团,其中,所述报告基团能够发出信号,并且,所述淬灭基团能够吸收或淬灭所述报告基团发出的信号;并且,所述检测探针在与其互补序列杂交的情况下发出的信号不同于在未与其互补序列杂交的情况下发出的信号;优选地,所述引物组包含一条上游引物和多条下游引物例如,2条,5条,10条,11条,或更多条;b在允许核酸扩增的条件下,通过荧光定量PCR,使用所述引物组以及所述检测探针对所述含有不同NUP98融合基因的靶核酸进行扩增,从而获得与扩增产物对应的扩增曲线以及Ct值;c以倍比稀释的扩增产物的浓度对数值为横坐标,以扩增产物对应的Ct值为纵坐标,分别构建扩增产物浓度与Ct值之间的标准曲线;优选地,对标准曲线的参数进行检测,判断所述标准曲线能否用于NUP98融合基因的定量检测;其中,所述参数选自标准曲线的相关系数,扩增效率,斜率,或其任何组合;更优选地,当标准曲线的相关系数R的平方大于0.99,扩增效率大于85%,斜率在-3.0至-4.0之间时,所述标准曲线可用于NUP98融合基因的定量检测;d通过Ct值与浓度的倍比关系,获得样品的靶核酸中不同NUP98融合基因的浓度;优选地,所述NUP98融合基因的序列包含编码NUP98蛋白的核苷酸的全部或部分序列和编码NUP98的伙伴蛋白例如,HHEX、HOXD13、LOC348801、TOP1、KDM5、DDX10、NDS1、NDS3、LEDGF、ADD3或PHF23的核苷酸的全部或部分序列;优选地,所述NUP98融合基因的序列选自SEQIDNO:28至SEQIDNO:38。
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