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摘要:本发明公开了一种Xp11.2的新易位伴侣FUBP1及其检测引物和应用。Xp11.2的新易位伴侣为FUBP1‑TFE3基因易位,FUBP1基因位于1p31.1,共22个外显子;基因融合发生于FUBP1的17号外显子与TFE3基因2号外显子之间;优选包含SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列。一种检测FUBP1‑TFE3易位性肿瘤的PCR引物,上游引物FUBP1‑E17‑F序列如SEQ ID NO.1所示;下游引物TFE3‑E2‑R序列如SEQ ID NO.2所示。本发明针对高通量测序发现的新融合位点设计了特异性的PCR引物,扩大了原引物组合的检测范围,应用于临床,可提高诊断该类肿瘤的检出率和准确率。
主权项:一种融合基因,其特征在于为FUBP1‑TFE3基因易位,FUBP1基因位于1号染色体,位置77944055‑77979494,序列来自GeneBank,序列版本号GRCh38.p7,共22个外显子;基因融合发生于FUBP1的17号外显子与TFE3基因2号外显子之间;所述的融合基因包含SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列。
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百度查询: 中国人民解放军南京军区南京总医院 一种Xp11.2的新易位伴侣FUBP1及其检测引物和应用
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