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龙图腾网恭喜重庆市润泽霖科核酸医药研究有限公司;北京睿博解码生物科技有限公司;中国科学院生物物理研究所申请的专利一种基于序列和结构信息的mRNA疫苗序列设计方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN116386727B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-01-07发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202310377507.8，技术领域涉及：G16B30/00；该发明授权一种基于序列和结构信息的mRNA疫苗序列设计方法是由宋廷瑞;陈润生;何顺民;郝頔;王晓娜设计研发完成，并于2023-04-11向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种基于序列和结构信息的mRNA疫苗序列设计方法在说明书摘要公布了：本发明涉及医学分子生物学技术领域，特别涉及一种基于序列和结构信息的mRNA疫苗序列设计方法，通过人工智能预测模型，结合免疫表位数据库、人类蛋白组以及残基柔性、序列保守型、免疫原性等特征，预测得到目标蛋白的重要表位位点，再通过中国人群的MHC类型覆盖情况，筛选出具有广泛的等位基因覆盖范围的免疫源序列；并且本方法能广泛应用于RNA病毒，实现常用的表位分析方案的智能规划和自动执行，为基础与临床结合的各项研究提供高效的方法和技术支持。

本发明授权一种基于序列和结构信息的mRNA疫苗序列设计方法在权利要求书中公布了：1.一种基于序列和结构信息的mRNA疫苗序列设计方法，其特征在于包括以下步骤：S1.构建目标蛋白的蛋白质结构；S2.对目标蛋白进行结构特征分析、序列保守性分析、肽段特征分析及肽段亲和力分析，获取相应特征数据；S3.将结构特征、序列保守性特征、肽段特征及肽段亲和力特征输入XGBoost学习模型中，基于弱分类算法，构建表位预测模型，用于筛选目标蛋白的重要表位位点；将公式I作为表位预测模型的训练目标，实现目标函数最小 其中，l*是损失函数，用来表示预测分数和真实分数yi之间的差距，为第i个样本xi在第t次迭代的预测值，即为第t-1次迭代的预测值加上第t次迭代的预测值ft；Ω*为正则项，用于防止由于树过于复杂而造成的过拟合现象，结合损失函数的一阶导数和二阶导数，使目标函数收敛更快；将公式II作为表位预测模型的生成策略，选择最小目标函数值作为根节点，并以此类推，直到建树结束，创建表位预测模型 其中，Dk表示第k个特征的每个样本的特征值xnk与相应的hi组成的集合，表示第k个特征的所有样本的hi总和，表示所有特征值小于z的样本的hi总和；在对特征进行阈值划分的过程中采用加权分位法，以二阶导数值hi作为样本的权重进行划分，寻找目标函数最小结点作为最佳分裂点。S4.将筛选出的重要表位位点对应的氨基酸序列及DNA序列，作为候选抗原序列，根据其与MHC的亲和力情况，筛选得到最佳免疫源序列。

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